मुख्य अंतर - प्रोटिओमिक्स बनाम ट्रांसक्रिप्टोमिक्स
ओमिक तकनीक एक वर्तमान प्रवृत्ति है, जहां किसी जीव के विभिन्न जैव-अणुओं को उसके गुणों और कार्यों के संबंध में एक संपूर्ण संग्रह के रूप में देखा जाता है। ओमिक तकनीक में अनुप्रयोगों की एक विस्तृत श्रृंखला है। एक जैविक नमूने के विभिन्न ओमिक्स में जीनोमिक्स, प्रोटिओमिक्स, ट्रांसक्रिपटॉमिक्स और मेटाबॉलिकमिक्स शामिल हैं। प्रोटिओमिक्स में एक जीवित जीव में सभी प्रोटीनों का संपूर्ण अध्ययन शामिल है। इसे एक जीव में सभी व्यक्त प्रोटीनों के समुच्चय, इसके संरचनात्मक और कार्यात्मक गुणों के रूप में परिभाषित किया गया है। इसलिए प्रोटीन का पूरा सेट प्रोटिओम बनाता है।ट्रांसक्रिपटॉमिक्स एक जीवित जीव में मौजूद सभी मैसेंजर आरएनए (एमआरएनए) अणुओं का पूरा अध्ययन है। इस प्रकार, ट्रांसक्रिपटॉमिक्स उन जीनों से संबंधित है जो एक जीवित जीव में सक्रिय रूप से व्यक्त किए जाते हैं। एक जीवित जीव में mRNA के कुल सेट को प्रतिलेख के रूप में जाना जाता है। प्रोटिओमिक्स और ट्रांसक्रिपटॉमिक्स के बीच महत्वपूर्ण अंतर बायोमोलेक्यूल के प्रकार पर आधारित है। प्रोटिओमिक्स में, एक जीवित जीव में व्यक्त प्रोटीन के कुल सेट का अध्ययन किया जाता है, जबकि ट्रांसक्रिपटॉमिक्स में, एक जीवित जीव के कुल mRNA का अध्ययन किया जाता है।
प्रोटिओमिक्स क्या है?
शब्द प्रोटिओमिक्स वर्ष 1995 में गढ़ा गया था और शुरुआत में इसे कोशिका, ऊतक या जीव में कुल प्रोटीन पूरक के रूप में परिभाषित किया गया था। प्रोटिओमिक अध्ययनों में प्रगति के साथ, इसे तब एक छत्र शब्द के रूप में माना जाने लगा जिसमें कई अध्ययन क्षेत्रों को शामिल किया गया था। वर्तमान में, प्रोटिओमिक्स विषय के तहत, संरचना, अभिविन्यास, कार्य, इसकी बातचीत, इसके संशोधन, इसके अनुप्रयोग और प्रोटीन के महत्व का अध्ययन किया जाता है।इसलिए, वर्तमान में प्रोटिओमिक्स के क्षेत्र में बहुत शोध किया जा रहा है।
पहला प्रोटिओमिक अध्ययन एस्चेरिचिया कोलाई में प्रोटीन सामग्री की पहचान करने के लिए किया गया था। कुल प्रोटीन सामग्री का मानचित्रण दो आयामी (2डी) जैल का उपयोग करके किया गया था। इसकी सफलता पर, वैज्ञानिकों ने गिनी सूअरों और चूहों जैसे जानवरों में कुल प्रोटीन सामग्री को चिह्नित करने के लिए आगे बढ़े। वर्तमान में, मानव प्रोटीन मानचित्रण 2डी जेल वैद्युतकणसंचलन का उपयोग करके किया जाता है।
प्रोटिओमिक्स के अनुप्रयोग
प्रोटिओमिक्स का अध्ययन करने के कई फायदे हैं, क्योंकि प्रोटीन के उत्प्रेरक गुण के कारण प्रोटीन अधिकांश गतिविधि के संचालक अणु होते हैं। इस प्रकार, संपूर्ण प्रोटीन का अध्ययन किसी जीव की स्वास्थ्य स्थिति के बारे में जानकारी प्रदान कर सकता है। कुछ अनुप्रयोग हैं;
- जीनोम एनोटेशन: किसी जीव की प्रोटीन सामग्री का अध्ययन करके, सक्रिय प्रोटीन यौगिक के लिए जिम्मेदार सटीक जीनोम निर्धारित किया जा सकता है। इस परिदृश्य में सभी जीनोमिक्स, ट्रांसक्रिपटॉमिक्स और प्रोटिओमिक्स के परिणाम महत्वपूर्ण हैं।
- रोग की पहचान / निदान: स्वस्थ और रोगग्रस्त की तुलना करके रोग की स्थिति की पहचान में प्रोटिओमिक्स का उपयोग किया जाता है
- प्रयोग के दौरान अध्ययन किए गए प्रोटीन अभिव्यक्ति को अंजाम देने के लिए।
- प्रोटीन संशोधन और अंतःक्रियात्मक अध्ययन: इन विट्रो स्थितियों में या विवो स्थितियों में प्रोटीन का उपयोग करने के लिए, इन निकाले गए प्रोटीनों की भंडारण की स्थिति तय करने के लिए और इन विट्रो में, विवो में और में प्रोटीन के व्यवहार का अध्ययन करने के लिए - सिलिको तरीके।
चित्र 01: प्रोटिओमिक्स
प्रोटिओमिक्स में विभिन्न तकनीकें शामिल हैं
- 2डी जेल वैद्युतकणसंचलन का उपयोग करके कुल प्रोटीन का निष्कर्षण और प्रोटीन को अलग करना। उच्च प्रदर्शन तरल क्रोमैटोग्राफी (एचपीएलसी) का उपयोग करके प्रोटीन को भी अलग किया जा सकता है।
- एडमंड की अनुक्रमण विधि या मास स्पेक्ट्रोमेट्री जैसी विधियों का उपयोग करके निकाले गए प्रोटीन का अनुक्रमण।
- एक बार अनुक्रमों की पहचान हो जाने के बाद, प्रोटीन सामग्री के संरचनात्मक और कार्यात्मक गुणों का विश्लेषण कंप्यूटर आधारित सॉफ्टवेयर और जैव सूचना विज्ञान उपकरणों का उपयोग करके किया जाता है।
ट्रांसक्रिप्टोमिक्स क्या है?
प्रतिलेख शब्द हाल ही में गढ़ा गया है। ट्रांसक्रिपटॉमिक्स एक जीव की कुल एमआरएनए सामग्री का अध्ययन है। कुल एमआरएनए एक जीवित जीव या कोशिका में व्यक्त डीएनए है। एमआरएनए के पूरे संग्रह को प्रतिलेख के रूप में संदर्भित किया जाता है।
प्रतिलेख का विश्लेषण करने की दिशा में कदम शामिल हैं,
- आरएनए का निष्कर्षण, पॉली डीटी मोतियों के साथ कॉलम जेल क्रोमैटोग्राफी का उपयोग करके एमआरएनए को अलग करना।
- एमआरएनए की सीक्वेंसिंग की जाती है।
माइक्रोएरे तकनीक किसी जीव के प्रतिलेख की पहचान करने का एक सामान्य तरीका है। माइक्रोएरे तकनीक में एक जांच प्लेट शामिल होती है जिसमें प्रतिलेख के पूरक किस्में होती हैं। संकरण पर, जीव या कोशिकाओं में मौजूद एमआरएनए की विशेषता हो सकती है।
चित्र 02: ट्रांसक्रिप्टोमिक तकनीक
ट्रांसक्रिपटॉमिक्स अब व्यापक रूप से चिकित्सा क्षेत्र में उपयोग किया जाता है। रोग निदान और रोग रूपरेखा मुख्य क्षेत्र हैं जिनमें ट्रांसक्रिप्टोमिक्स का उपयोग किया जाता है। किसी जीव के प्रतिलेख का विश्लेषण करके, विदेशी mRNA की पहचान की जा सकती है, और यदि कोई संक्रमण है, तो उसकी पहचान की जा सकती है। गैर-कोडिंग आरएनए को ट्रांसक्रिपटामिक तकनीकों का उपयोग करके अलग किया जा सकता है। और विभिन्न पर्यावरणीय तनावों के तहत जीन की अभिव्यक्ति पर भी नजर रखी जा सकती है।
प्रोटिओमिक्स और ट्रांसक्रिप्टोमिक्स के बीच समानताएं क्या हैं?
- दोनों ओमिक तकनीक की अवधारणा का हिस्सा हैं।
- दोनों का उपयोग किसी जीव के रोग निदान और रोग लक्षण वर्णन में किया जाता है।
- दोनों अध्ययन क्षेत्रों में जैव-अणु का निष्कर्षण, जैव-अणु का पृथक्करण और अनुक्रमण चरण शामिल थे।
प्रोटिओमिक्स और ट्रांसक्रिप्टोमिक्स में क्या अंतर है?
प्रोटेमिक्स बनाम ट्रांसस्क्रिप्टोमिक्स |
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| प्रोटिओमिक्स में एक जीवित जीव में सभी प्रोटीनों का संपूर्ण अध्ययन शामिल है। | ट्रांसक्रिपटॉमिक्स एक जीवित जीव में मौजूद सभी मैसेंजर आरएनए (एमआरएनए) अणुओं का संपूर्ण अध्ययन है। |
| जैव अणु प्रकार का अध्ययन | |
| प्रोटिओमिक्स में प्रोटीन का अध्ययन किया जाता है। | एमआरएनए का ट्रांसक्रिपटॉमिक्स में अध्ययन किया जाता है। |
| अध्ययन किए गए कारक | |
| प्रोटिओमिक्स में प्रोटीन की संरचना, कार्य, अंतःक्रिया, संशोधन और अनुप्रयोगों का अध्ययन किया जाता है। | अनुक्रम संरचना, पर्यावरण के साथ बातचीत और mRNA के अनुप्रयोगों का अध्ययन ट्रांसक्रिपटॉमिक्स में किया जाता है। |
सारांश - प्रोटिओमिक्स बनाम ट्रांसक्रिप्टोमिक्स
जीवन विज्ञान के क्षेत्र में ओमिक्स एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। प्रोटिओमिक्स प्रोटिओम के अध्ययन को संदर्भित करता है जो एक कोशिका या जीव में प्रोटीन का पूरा संग्रह बनाता है। ट्रांसक्रिपटॉमिक्स ट्रांसक्रिप्टोम के अध्ययन को संदर्भित करता है जो व्यक्त डीएनए का पूरा सेट है जो एमआरएनए के रूप में है। दो अध्ययन क्षेत्रों, प्रोटिओमिक्स और ट्रांसक्रिपटॉमिक्स, जीनोमिक्स की शुरूआत के बाद प्राप्त हुए थे और वर्तमान में चिकित्सा निदान में और जीवों के लक्षण वर्णन और स्क्रीनिंग में व्यापक रूप से उपयोग किए जाते हैं। यह प्रोटिओमिक्स और ट्रांसक्रिपटॉमिक्स के बीच का अंतर है।
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