शआरएनए बनाम सिरना
आरएनए हस्तक्षेप (आरएनएआई) की प्रक्रिया के दौरान, लक्ष्य जीन की अभिव्यक्ति उच्च विशिष्टता और चयनात्मकता के साथ नीचे दस्तक देती है। आरएनएआई एक प्राकृतिक प्रक्रिया है, और इसमें छोटे हस्तक्षेप करने वाले आरएनए (siRNA) और छोटे हेयरपिन RNA (shRNA) और द्वि-कार्यात्मक shRNA शामिल हैं। वर्तमान में, आरएनएआई का व्यापक रूप से व्यक्तिगत कैंसर चिकित्सा के लिए एक उपकरण के रूप में उपयोग किया जाता है। आरएनएआई के अनुप्रयोग मूल रूप से रासायनिक रूप से संश्लेषित डबल-स्ट्रैंडेड siRNA और वेक्टर आधारित shRNA अणुओं के साथ किए जाते हैं। यद्यपि इन दो अणुओं के समान कार्यात्मक परिणाम होते हैं, वे अपनी संरचना में भिन्न होते हैं; इस प्रकार, क्रिया के आणविक तंत्र, आरएनए मार्ग, और इन दो अणुओं के लक्ष्य से परे प्रभाव भी भिन्न होते हैं।
शआरएनए
shRNA छोटे आरएनए अणु का एक क्रम है जो एक तंग हेयरपिन मोड़ बनाता है जिसका उपयोग आरएनएआई के दौरान एक लक्ष्य जीन अभिव्यक्ति को शांत करने के लिए किया जा सकता है। shRNA की अभिव्यक्ति एक वेक्टर द्वारा प्राप्त की जाती है, जो या तो एक वायरस या एक जीवाणु हो सकता है या प्लास्मिड के वितरण द्वारा हो सकता है। उन्हें कोशिकाओं के केंद्रक में संश्लेषित किया जाता है और आगे की प्रक्रियाओं के लिए साइटोप्लाज्म में ले जाया जाता है। इन अणुओं में miRNA के समान परिपक्वता पथ होते हैं; इस प्रकार miRNA के संश्लेषण ने shRNA संश्लेषण को समझने के लिए आधार प्रदान किया है। या तो आरएनए पोलीमरेज़ II या III आरएनए पोलीमरेज़ II या III प्रमोटरों के माध्यम से shRNA को ट्रांसक्रिप्ट कर सकता है। shRNAs के उपयोग का लाभ यह है कि उनके पास गिरावट और कारोबार की अपेक्षाकृत कम दर है। नुकसान यह है कि इसे एक अभिव्यक्ति वेक्टर की आवश्यकता होती है, जिससे कुछ सुरक्षा समस्याएं हो सकती हैं।
siRNA
siRNAs डबल स्ट्रैंडेड RNA अणु होते हैं जो लंबाई में 20- 25 बेस पेयर से बने होते हैं। इनका उपयोग आरएनएआई मार्ग में पूरक न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम वाले किसी भी जीन को शांत करके जीन दमन के लिए किया जाता है।सीआरएनए के अभिकर्मक द्वारा जीन पछाड़ना क्षणिक प्रभाव के कारण अक्सर असफल होता है; विशेष रूप से तेजी से विभाजित होने वाली कोशिकाओं में और दमन अधिक समय तक नहीं रहता है। इस समस्या को दूर करने के लिए, एक छोटी हेयरपिन संरचना की शुरुआत करके siRNA को संशोधित किया जाता है। यह संशोधित अणु तब shRNA के रूप में जाना जाता था। अपने सामान्य कार्य को आगे बढ़ाने के लिए shRNA को एक डिसर द्वारा siRNA में परिवर्तित किया जाना चाहिए।
shRNA और siRNA में क्या अंतर है?
• siRNA के विपरीत, shRNA में एक अतिरिक्त हेयरपिन संरचना होती है। shRNA, siRNA का संशोधित संस्करण है।
• shRNA को एक्सप्रेशन वेक्टर की आवश्यकता होती है, जबकि siRNA को नहीं।
• shRNA का उपयोग दीर्घकालिक नॉकडाउन के लिए किया जा सकता है जबकि siRNA का उपयोग केवल जीन के अल्पकालिक नॉकडाउन के लिए किया जा सकता है।
• siRNA के जीन दमन के विपरीत, shRNA का दमन लंबे समय तक चलने वाला होता है, और यदि इसे एक उपयुक्त वायरल वेक्टर के माध्यम से डाला जाता है, तो यह स्थायी जीन मौन प्रभाव उत्पन्न कर सकता है।
• अपने सामान्य कार्यों को निष्पादित करने के लिए shRNA को वापस siRNA अणु में परिवर्तित करने के लिए डिसर की आवश्यकता होती है।
