हेलिक्स-लूप-हेलिक्स और हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स के बीच महत्वपूर्ण अंतर यह है कि हेलिक्स-लूप-हेलिक्स प्रोटीन डिमराइजेशन की मध्यस्थता करता है जबकि हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स डीएनए बाइंडिंग के माध्यम से जीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित करता है।
एक प्रोटीन आकृति डीएनए के विशिष्ट कार्यों से जुड़ा एक संक्षिप्त-संरक्षित अनुक्रम है। यह मुख्य रूप से एक विशेष संरचनात्मक साइट के साथ एक अद्वितीय रासायनिक या जैविक कार्य के साथ जुड़ा हुआ है। इन रूपांकनों में विभिन्न प्रोटीन अणुओं के साथ अमीनो एसिड की त्रि-आयामी संरचनाओं के छोटे क्षेत्र होते हैं। आमतौर पर, व्यक्तिगत रूपांकनों में केवल कुछ तत्व होते हैं। हेलिक्स-लूप-हेलिक्स और हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स में तीन तत्व होते हैं।उनके प्रोटीन संरचनात्मक रूपांकनों में अलग-अलग लंबाई और अनिर्दिष्ट संरचनाओं के साथ लूप शामिल हैं।
हेलिक्स-लूप-हेलिक्स क्या है?
एक हेलिक्स-लूप-हेलिक्स (HLH) एक प्रोटीन संरचनात्मक आकृति है जो डिमराइज़िंग ट्रांसक्रिप्शन कारकों के सबसे बड़े परिवारों में से एक को परिभाषित करता है। इन प्रतिलेखन कारकों में डीएनए बंधन तंत्र को सुविधाजनक बनाने के लिए अमीनो एसिड के अवशेष होते हैं, और वे डिमेरिक होते हैं। प्रोटीन संरचनात्मक आकृति में दो α-हेलीकॉप्टर होते हैं, और वे एक लूप से जुड़े होते हैं। एक हेलिक्स दो हेलिक्स से छोटा दिखाई देता है, और लूप का लचीलापन दूसरे हेलिक्स के खिलाफ पैकिंग और फोल्ड करके डिमराइजेशन की अनुमति देता है। जो हेलिक्स बड़ा दिखाई देता है उसमें आमतौर पर डीएनए-बाध्यकारी क्षेत्र होते हैं। एचएलएच प्रोटीन एक आम सहमति अनुक्रम से बंधते हैं जिसे ई-बॉक्स के रूप में जाना जाता है। सर्वसम्मति अनुक्रम एक परिकलित क्रम है जिसमें न्यूक्लियोटाइड या अमीनो एसिड अवशेष होते हैं। ई-बॉक्स कुछ यूकेरियोट्स में डीएनए के प्रति प्रतिक्रिया करने वाला एक तत्व है जो प्रोटीन-बाध्यकारी साइट के रूप में कार्य करता है और जीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित करता है।
चित्र 01: हेलिक्स-लूप-हेलिक्स मोटिफ
HLH प्रतिलेखन कारक विकास और कोशिका गतिविधि के लिए आवश्यक हैं। एचएलएच प्रोटीन मुख्य रूप से छह समूहों से संबंधित होते हैं, जिन्हें ए से एफ तक अक्षरों से दर्शाया जाता है। प्रत्येक समूह में शामिल ट्रांसक्रिप्शन कारक हैं:
ग्रुप ए: MyoD, Myf5, Beta2/NeuroD1, Scl, p-CaMK, NeuroD, और Neurogenins, ग्रुप B: MAX, C-Myc, N-Myc, और TCF4
ग्रुप सी: एएचआर, बीएमएएल-1-क्लॉक, एचआईएफ, एनपीएएस1, एनपीएएस3, और एमओपी5
ग्रुप डी; ईएमसी
ग्रुप ई: HEY1 और HEY2
ग्रुप एफ: EBF1
चूंकि एचएलएच के अधिकांश ट्रांसक्रिप्शन कारक हेटेरोडिमेरिक हैं, डिमराइजेशन अक्सर उन्हें नियंत्रित करता है।
हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स क्या है?
हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स (HTH) एक प्रोटीन संरचनात्मक आकृति है जो डीएनए को बांधने में सक्षम है। प्रत्येक मोनोमर दो α-हेलीकॉप्टर के साथ व्यवस्थित होता है और एक छोटे अमीनो एसिड स्ट्रैंड से जुड़ा होता है। यह डीएनए हेलिक्स में एक खांचे से बांधता है। HTH रूपांकनों आमतौर पर जीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित करते हैं। एचटीएच की पहचान और डीएनए के लिए बाध्यकारी दो α-हेलीकॉप्टरों द्वारा किया जाता है। एक हेलिक्स एन-टर्मिनल छोर पर है जबकि दूसरा सी-टर्मिनस पर है। ज्यादातर परिदृश्यों में, हेलिक्स डीएनए की पहचान करता है। इसलिए, इसे मान्यता हेलिक्स के रूप में जाना जाता है। डीएनए में खांचे से बंधन वैन डेर वाल्स इंटरैक्शन और हाइड्रोजन बॉन्ड की एक श्रृंखला के माध्यम से होता है, जिसमें बेस उजागर होते हैं। अन्य α-हेलिक्स प्रोटीन और डीएनए परस्पर क्रिया को स्थिर करता है और मान्यता में प्रमुख भूमिका नहीं निभाता है। हालाँकि, मान्यता हेलिक्स और शेष हेलिक्स का एक समान अभिविन्यास है।
चित्र 02: TetR परिवार का हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स
HTH को हेलिकॉप्टर की संरचना और स्थानिक व्यवस्था के अनुसार वर्गीकृत किया गया है। मुख्य प्रकार द्वि-पेचदार, त्रि-पेचदार, टेट्रा-पेचदार और पंखों वाला HTH हैं। द्वि-पेचदार प्रकार दो हेलिकॉप्टरों और एक स्वतंत्र तह प्रोटीन डोमेन के साथ सबसे सरल प्रकार है। त्रि-पेचदार प्रकार ट्रांसक्रिप्शनल एक्टीवेटर माइब में पाया जाता है। टेट्रा-हेलिकल प्रकार में एक अतिरिक्त सी-टर्मिनल हेलिक्स होता है। अंत में, पंखों वाला एचटीएच 3-पेचदार बंडल और 3- या 4- स्ट्रैंड बीटा शीट द्वारा बनता है।
हेलिक्स-लूप-हेलिक्स और हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स में क्या समानताएं हैं?
- हेलिक्स-लूप-हेलिक्स और हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स प्रोटीन संरचनात्मक रूपांकनों हैं।
- दोनों में बेसल और विशिष्ट ट्रांसक्रिप्शन कारकों में एक आम भाजक होता है।
- वे यूकेरियोट्स में मौजूद हैं।
हेलिक्स-लूप-हेलिक्स और हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स में क्या अंतर है?
हेलिक्स-लूप-हेलिक्स प्रोटीन डिमराइजेशन की मध्यस्थता करता है, जबकि हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स डीएनए बाइंडिंग के माध्यम से जीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित करता है। इस प्रकार, यह हेलिक्स-लूप-हेलिक्स और हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स के बीच महत्वपूर्ण अंतर है। इसके अलावा, HLH में कुछ प्रोटो-ऑन्कोजीन और जीन होते हैं जो विभेदन एन्कोडिंग प्रतिलेखन कारकों में शामिल होते हैं जबकि HTH में कई घरेलू जीन होते हैं जो प्रतिलेखन कारकों के लिए कोड होते हैं। इसके अलावा, हेलिक्स-लूप-हेलिक्स में मुख्य रूप से एक लूप से जुड़े अल्फा-हेलिक्स होते हैं, जबकि हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स में मुख्य रूप से लूप होते हैं जो एक छोटे अमीनो एसिड स्टैंड से एक नाली बनाते हैं।
नीचे दिए गए इन्फोग्राफिक में हेलिक्स-लूप-हेलिक्स और हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स के बीच अंतर को सारणीबद्ध रूप में एक साथ तुलना के लिए प्रस्तुत किया गया है।
सारांश - हेलिक्स-लूप-हेलिक्स बनाम हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स
एक प्रोटीन आकृति डीएनए के विशिष्ट कार्यों से जुड़ा एक संक्षिप्त-संरक्षित अनुक्रम है।हेलिक्स-लूप-हेलिक्स और हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स दो प्रकार के प्रोटीन संरचनात्मक रूपांकनों हैं। हेलिक्स-लूप-हेलिक्स और हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स के बीच महत्वपूर्ण अंतर यह है कि हेलिक्स-लूप-हेलिक्स प्रोटीन डिमराइजेशन की मध्यस्थता करता है, जबकि हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स डीएनए बाइंडिंग के माध्यम से जीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित करता है। एचएलएच एक प्रोटीन संरचनात्मक आकृति है जो डिमराइजिंग ट्रांसक्रिप्शन कारकों के सबसे बड़े परिवारों में से एक को परिभाषित करता है। प्रोटीन संरचनात्मक आकृति में दो α-हेलीकॉप्टर होते हैं, और वे एक लूप से जुड़े होते हैं। एचटीएच एक प्रोटीन संरचनात्मक आकृति है जो डीएनए को बांधने में सक्षम है। प्रत्येक मोनोमर दो α-हेलीकॉप्टर के साथ व्यवस्थित होता है, और एक छोटे अमीनो एसिड स्ट्रैंड से जुड़ा होता है और डीएनए हेलिक्स में एक खांचे से बांधता है। तो, यह हेलिक्स-लूप-हेलिक्स और हेलिक्स-टर्न-हेलिक्स के बीच अंतर को सारांशित करता है।
