अनुक्रम संरेखण में समानता और पहचान के बीच महत्वपूर्ण अंतर यह है कि समानता तुलना में दो अनुक्रमों के बीच समानता (समानता) है जबकि पहचान वर्णों की संख्या है जो दो अलग-अलग अनुक्रमों के बीच बिल्कुल मेल खाते हैं।
जैव सूचना विज्ञान विज्ञान का एक अंतःविषय क्षेत्र है जिसमें मुख्य रूप से आणविक जीव विज्ञान और आनुवंशिकी, कंप्यूटर विज्ञान, गणित और सांख्यिकी शामिल हैं। जैव सूचना विज्ञान में अनुक्रम संरेखण एक प्रमुख शब्द है। यह वह प्रक्रिया है जिसमें डीएनए, आरएनए या प्रोटीन के अनुक्रमों को समानता के क्षेत्रों की पहचान करने के लिए व्यवस्थित किया जाता है जो अनुक्रमों के बीच कार्यात्मक, संरचनात्मक या विकासवादी संबंध का परिणाम है।संरेखण के अंत में, उन्हें एक मैट्रिक्स के भीतर पंक्तियों के रूप में प्रस्तुत किया जाएगा। लगातार कॉलम में समान वर्णों को संरेखित करने के लिए, अवशेषों के बीच सम्मिलित अंतराल मौजूद होते हैं।
समानता क्या है?
अनुक्रम संरेखण में समानता तुलना करने पर दो अनुक्रमों के बीच समानता है। यह तथ्य अनुक्रमों की पहचान पर निर्भर है। समानता दर्शाती है कि अवशेष किस हद तक संरेखित हैं। इसलिए, समान अनुक्रमों में समान गुण होते हैं। जैव सूचना विज्ञान में, समानता दो प्रोटीनों के बीच समानता का आकलन करने का एक उपकरण है।
चित्र 01: अनुक्रम संरेखण में समानता
संरेखण प्रक्रिया को अनुक्रमित करने के दो मुख्य चरण हैं। प्रारंभिक चरण जोड़ी-वार संरेखण है, जो BLAST, FastA और LALIGN जैसे एल्गोरिदम का उपयोग करके दो अनुक्रमों (अंतराल सहित) के बीच इष्टतम संरेखण खोजने में मदद करता है।मिलान करने वाला एल्गोरिथम संपादन कार्यों की न्यूनतम संख्या पाता है; एक क्रम को दूसरे क्रम में संरेखित करने के लिए in-dels और प्रतिस्थापन। जोड़ी-वार संरेखण के बाद, प्रत्येक जोड़ी-वार तुलना से दो मात्रात्मक पैरामीटर प्राप्त करना आवश्यक है। वे पहचान और समानता हैं।
पहचान क्या है?
अनुक्रम संरेखण में पहचान दो अलग-अलग अनुक्रमों के बीच सटीक रूप से मेल खाने वाले वर्णों की संख्या है। इसलिए, पहचान का आकलन करते समय अंतराल की गणना नहीं की जाती है। माप को दो अनुक्रमों के बीच छोटे अनुक्रम से संबंधित माना जाता है। यह महत्वपूर्ण रूप से तात्पर्य है कि इसका प्रभाव है जहां अनुक्रम पहचान सकर्मक नहीं है। यदि X=Y और Y=Z, तो X जरूरी नहीं कि Z के बराबर हो। यह पहचान दूरी माप के संदर्भ में घटा है।
चित्र 02: अनुक्रम संरेखण में पहचान
उदाहरण के लिए, एक्स में एएजीजीसीटीटी का अनुक्रम है, वाई में एएजीजीसी का अनुक्रम है और जेड में एएजीजीसीएटी का अनुक्रम है। X और Y के बीच की पहचान 100% {5 समान न्यूक्लियोटाइड / मिनट [लंबाई (X), लंबाई (Y)]} है। Y और Z के बीच की पहचान भी 100% है। लेकिन X और Z के बीच की पहचान केवल 85% {(6 समान न्यूक्लियोटाइड / 7)} है।
अनुक्रम संरेखण में समानता और पहचान के बीच समानताएं क्या हैं?
- समानता और पहचान दोनों दो ऐसे शब्द हैं जिनका उपयोग हम अनुक्रम संरेखण में करते हैं।
- इसके अलावा, वे दो अनुक्रमों के बीच समानता का उल्लेख करते हैं।
- इसके अलावा, हम उन्हें प्रतिशत मान के रूप में व्यक्त करते हैं।
अनुक्रम संरेखण में समानता और पहचान के बीच अंतर क्या है?
संरेखण में समानता दो अनुक्रमों के बीच समानता को बताती है जब तुलना की जाती है जबकि अनुक्रम संरेखण में पहचान दो अलग-अलग अनुक्रमों के बीच बिल्कुल मेल खाने वाले वर्णों की मात्रा बताती है।इसलिए, अनुक्रम संरेखण में समानता और पहचान के बीच यह महत्वपूर्ण अंतर है।
सारांश - अनुक्रम संरेखण में समानता बनाम पहचान
अनुक्रम संरेखण अनुक्रमों के बीच कार्यात्मक, संरचनात्मक या विकासवादी संबंध के कारण डीएनए, आरएनए या प्रोटीन में समानता के क्षेत्रों की पहचान करने में मदद करता है। इसलिए, अनुक्रम संरेखण के संदर्भ में समानता और पहचान दो प्रमुख शब्द हैं। इन दो शब्दों के बीच महत्वपूर्ण अंतर यह है कि समानता दो अनुक्रमों के बीच समानता है, जबकि पहचान दो अलग-अलग अनुक्रमों के बीच बिल्कुल मेल खाने वाले वर्णों की संख्या है। इस प्रकार, यह अनुक्रम संरेखण में समानता और पहचान के बीच अंतर का सारांश है।
