जाइलीन सायनोल और ब्रोमोफेनॉल ब्लू के बीच मुख्य अंतर यह है कि 1% agarose जेल में, xylene सायनोल धीमी गति से माइग्रेट करता है, जबकि ब्रोमोफेनॉल ब्लू तेजी से माइग्रेट करता है।
ज़ाइलीन साइनॉल और ब्रोमोफेनॉल नीला रंग मार्कर के रूप में महत्वपूर्ण हैं जिनका उपयोग agarose gel वैद्युतकणसंचलन और पॉलीएक्रिलामाइड जेल वैद्युतकणसंचलन की प्रक्रिया की निगरानी में किया जा सकता है।
ज़ाइलीन साइनॉल क्या है?
Xylene cyanol एक इलेक्ट्रोफोरेटिक रंग मार्कर या एक ट्रैकिंग डाई है। यह agarose gel वैद्युतकणसंचलन और polyacrylamide gel वैद्युतकणसंचलन की प्रक्रिया की निगरानी में उपयोगी है। जब इस पदार्थ को नमूने के साथ मिलाया जाता है, तो इस पदार्थ की सांद्रता आमतौर पर लगभग 0 हो जाती है।005% से 0.03%। कुछ समानार्थक शब्द जो हम xylene cyanol के लिए उपयोग कर सकते हैं, उनमें एसिड ब्लू 147, xylene cyanole, xylene cyanol FF, xylene cyanole FF, आदि शामिल हैं।
इस यौगिक का रासायनिक सूत्र है C25H27N2NaO 6S2 जाइलीन सायनॉल का दाढ़ द्रव्यमान 538.61 g/mol है। यह पदार्थ 1% agarose जैल में लगभग 4-5 किलोबेस जोड़ी डीएनए अंशों की दर से माइग्रेट कर सकता है। हालाँकि, यह उस बफर पर निर्भर करता है जिसका हम उपयोग करते हैं। आमतौर पर, 6% पॉलीएक्रिलामाइड जेल पर जाइलीन साइनॉल लगभग 140 बेस पेयर डीएनए टुकड़ों की गति से माइग्रेट कर सकता है। दूसरी ओर, यह 25 बेस ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड की दर से पॉलीएक्रिलामाइड जेल वैद्युतकणसंचलन को 20% में स्थानांतरित कर सकता है।
जाइलीन साइनॉल की हाइड्रोजन बॉन्ड डोनर काउंट 2m है, और हाइड्रोजन बॉन्ड स्वीकर्ता की संख्या 8 है। इस कंपाउंड की रोटेटेबल बॉन्ड काउंट 7 के रूप में दी जा सकती है। xylene cyanol की जटिलता को 1120 डिग्री के रूप में वर्णित किया जा सकता है। इसकी एक परिभाषित बंधन स्टीरियोसेंटर गिनती 1 है।
ब्रोमोफेनॉल ब्लू क्या है?
ब्रोमोफेनॉल नीला एक उपयोगी पीएच संकेतक है जो इलेक्ट्रोफोरेटिक रंग मार्कर और डाई के रूप में उपयोगी है। इसका रासायनिक नाम 3', 3', 5', 5'-tetrabromophenolsulfonphthalein, BPB है। इस यौगिक का रासायनिक सूत्र है C19H10Br4O5 एस. इस यौगिक का दाढ़ द्रव्यमान 669.96 g/mol है। यह गंधहीन होता है, और इसका घनत्व 2.2 g/mL दिया जा सकता है। इसका गलनांक 273 डिग्री सेल्सियस और इसका क्वथनांक 279 डिग्री सेल्सियस होता है। हम ग्लेशियल एसिटिक एसिड में फिनोलसल्फोनफ्थेलिन के गर्म घोल में धीरे-धीरे अतिरिक्त ब्रोमीन मिलाकर इसे तैयार कर सकते हैं।
ब्रोमोफेनॉल नीला पीएच 3.0 से 4.6 के बीच एसिड-बेस इंडिकेटर के रूप में उपयोगी है। यह पीएच 3.0 पर पीले से पीएच 4.6 में बदलने में सक्षम है। इसके अलावा, यह एक प्रतिवर्ती प्रतिक्रिया है। संरचनात्मक रूप से, ब्रोमोफेनॉल नीला फिनोलफथेलिन के समान है।
इसके अलावा, हम इसे agarose gel वैद्युतकणसंचलन और polyacrylamide gel वैद्युतकणसंचलन की प्रक्रिया की निगरानी के लिए एक रंग मार्कर के रूप में उपयोग कर सकते हैं। यह पदार्थ मध्यम पीएच पर एक नकारात्मक चार्ज ले सकता है, जहां यह उसी दिशा में माइग्रेट कर सकता है जैसे जेल में डीएनए या प्रोटीन। जेल घनत्व और बफर संरचना के अनुसार प्रवासन दर भिन्न हो सकती है। हालांकि, 1 बार टीएई बफर या टीबीई बफर में एक विशिष्ट 1% agarose जेल में, यह पदार्थ लगभग 300 बेस जोड़े के डीएनए टुकड़े के समान दर पर माइग्रेट करता है।
ज़ाइलीन साइनॉल और ब्रोमोफेनॉल ब्लू में क्या अंतर है?
ज़ाइलीन सायनॉल और ब्रोमोफेनॉल नीला महत्वपूर्ण रंग मार्कर हैं। xylene cyanol और bromophenol blue के बीच महत्वपूर्ण अंतर यह है कि 1% agarose gel में, xylene cyanol धीमी गति से माइग्रेट करता है, जबकि bromophenol blue तेज़ी से माइग्रेट करता है।
अगल-बगल तुलना के लिए नीचे सारणीबद्ध रूप में xylene cyanol और bromophenol blue के बीच अंतर का सारांश दिया गया है।
सारांश - जाइलीन साइनॉल बनाम ब्रोमोफेनॉल ब्लू
ज़ाइलीन सायनॉल और ब्रोमोफेनॉल नीला महत्वपूर्ण हैं क्योंकि रंग मार्करों का उपयोग agarose gel वैद्युतकणसंचलन और पॉलीएक्रिलामाइड जेल वैद्युतकणसंचलन की प्रक्रिया की निगरानी में किया जाता है। xylene cyanol और bromophenol blue के बीच महत्वपूर्ण अंतर यह है कि 1% agarose gel में, xylene cyanol धीमी गति से माइग्रेट करता है जबकि bromophenol blue तेज़ी से माइग्रेट करता है।