एमएलवीए और एमएलएसटी के बीच मुख्य अंतर यह है कि एमएलवीए माइक्रोबियल प्रजातियों की विशेषता के लिए अग्रानुक्रम दोहराए गए डीएनए अनुक्रमों के बहुरूपता का उपयोग करता है, जबकि एमएलएसटी माइक्रोबियल प्रजातियों की विशेषता के लिए कई हाउसकीपिंग जीनों के आंतरिक टुकड़ों के डीएनए अनुक्रमों के बहुरूपता का उपयोग करता है।
माइक्रोबियल टाइपिंग आमतौर पर संक्रमण के स्रोत और मार्गों को निर्धारित करने के लिए प्रयोग किया जाता है। यह प्रकोपों की पुष्टि या नियम करता है। माइक्रोबियल टाइपिंग भी स्वास्थ्य से जुड़े रोगजनकों के क्रॉस-ट्रांसमिशन का पता लगाती है और वायरल स्ट्रेन को पहचानती है। इसके अलावा, माइक्रोबियल टाइपिंग रोगजनक माइक्रोबियल प्रजातियों के नियंत्रण उपायों की प्रभावशीलता का मूल्यांकन करती है।MLVA और MLST दो आणविक जैविक तकनीकें हैं जिनका उपयोग माइक्रोबियल टाइपिंग में किया जाता है।
एमएलवीए क्या है?
मल्टीपल लोकी वीएनटीआर विश्लेषण (एमएलवीए) एक आणविक जैविक विधि है जो माइक्रोबियल प्रजातियों को चिह्नित करने के लिए डीएनए अनुक्रमों के बहुरूपता का उपयोग करती है। यह विशेष माइक्रोबियल प्रजातियों के आनुवंशिक विश्लेषण के लिए इस्तेमाल की जाने वाली एक विधि है।
एमएलवीए के पहले चरण के दौरान, प्रत्येक लक्षित वीएनटीआर लोकस को पीसीआर द्वारा फ्लैंकिंग क्षेत्र-विशिष्ट प्राइमरों के साथ प्रवर्धित किया जाता है। फिर प्राप्त टुकड़े एक केशिका सीक्वेंसर पर वैद्युतकणसंचलन द्वारा अलग किए गए आकार के होते हैं। प्रत्येक स्थान के जीनोटाइपिंग और प्रत्येक नमूने से संकलित परिणाम एक सूक्ष्मजीव को चिह्नित करने की अनुमति देते हैं जिसकी प्रजाति ज्ञात है। यह एलील टाइपिंग और एमएलवीए डेटाबेस की तुलना के माध्यम से उप-प्रजातियों की पहचान करने की भी अनुमति देता है।
चित्र 01: एमएलवीए
यह MLVA विधि MLST विधि की तुलना में अधिक चयनात्मक है। इसके अलावा, एमएलवीए विधि को डीएनए अनुक्रमण चरण की आवश्यकता नहीं होती है। इस प्रकार, यह निकट उप-प्रजातियों या क्लोनल प्रजातियों में अंतर करना संभव बनाता है।
एमएलएसटी क्या है?
मल्टीलोकस सीक्वेंस टाइपिंग (एमएलएसटी) एक ऐसी तकनीक है जो माइक्रोबियल प्रजातियों की विशेषता के लिए कई हाउसकीपिंग जीनों के आंतरिक टुकड़ों के डीएनए अनुक्रमों के बहुरूपता का उपयोग करती है। MLST कई लोकी टाइप करने के लिए आनुवंशिक विश्लेषण में एक तकनीक है।
चित्र 02: एमएलएसटी
यह एक प्रकार की अनुक्रमण टाइपिंग है जिसका उपयोग माइक्रोबियल प्रजातियों के विभिन्न उपभेदों को अलग करने के लिए एक संदर्भ तकनीक के रूप में किया जाता है। यह विधि हाउसकीपिंग जीन अनुक्रमण पर आधारित है।हाउसकीपिंग जीन सामान्य रूप से जीवाणु जैसे माइक्रोबियल एजेंटों के आवश्यक प्रोटीन को एन्कोड करते हैं। हाउसकीपिंग जीन के इन अनुक्रमों में समय के साथ एक स्थिर बहुरूपता प्रस्तुत करने की विशिष्टता होती है। इसलिए, हाउसकीपिंग जीन के अनुक्रमों में अंतर एक दूसरे से उपभेदों को अलग करने के लिए पर्याप्त है। इसके अलावा, विकसित की जाने वाली पहली एमएलएसटी योजना निसेरिया मेनिंगिटिडिस थी, जो मेनिंगोकोकल मेनिन्जाइटिस और सेप्टीसीमिया का प्रेरक एजेंट था। इसकी शुरूआत के बाद से, एमएलएसटी का उपयोग न केवल मानव रोगजनकों के लिए बल्कि पौधों के रोगजनकों के लिए भी किया गया है।
एमएलवीए और एमएलएसटी में क्या समानताएं हैं?
- MLVA और MLST दो आणविक जैविक तकनीकें हैं जिनका उपयोग माइक्रोबियल टाइपिंग में किया जाता है।
- दोनों तकनीकों का उपयोग माइक्रोबियल फ़ाइलोजेनेटिक विश्लेषण के लिए किया जा सकता है।
- दोनों तकनीक आनुवंशिक बहुरूपता पर आधारित हैं।
- उनका उपयोग माइक्रोबियल रोगजनक पैदा करने वाले मानव रोगों का पता लगाने के लिए किया जा सकता है।
- दोनों तकनीकों का प्रदर्शन कुशल आणविक जीवविज्ञानी द्वारा किया जाना चाहिए।
MLVA और MLST में क्या अंतर है?
MLVA एक ऐसी तकनीक है जो माइक्रोबियल प्रजातियों को चिह्नित करने के लिए मिलकर दोहराए गए डीएनए अनुक्रमों के बहुरूपता का उपयोग करती है। इस बीच, एमएलएसटी एक ऐसी तकनीक है जो माइक्रोबियल प्रजातियों की विशेषता के लिए कई हाउसकीपिंग जीनों के आंतरिक टुकड़ों के डीएनए अनुक्रमों के बहुरूपता का उपयोग करती है। इस प्रकार, यह MLVA और MLST के बीच महत्वपूर्ण अंतर है। इसके अलावा, एमएलवीए विधि एमएलएसटी विधि की तुलना में अधिक चयनात्मक है।
नीचे दिया गया इन्फोग्राफिक एमएलवीए और एमएलएसटी के बीच अंतर को साथ-साथ तुलना के लिए सारणीबद्ध रूप में प्रस्तुत करता है।
सारांश – एमएलवीए बनाम एमएलएसटी
MLVA और MLST दो आणविक जैविक तकनीकें हैं जिनका उपयोग माइक्रोबियल टाइपिंग में किया जाता है। एमएलवीए माइक्रोबियल प्रजातियों की विशेषता के लिए एक साथ दोहराए गए डीएनए अनुक्रमों के बहुरूपता का उपयोग करता है, जबकि एमएलएसटी माइक्रोबियल प्रजातियों की विशेषता के लिए कई हाउसकीपिंग जीनों के आंतरिक टुकड़ों के डीएनए अनुक्रमों के बहुरूपता का उपयोग करता है।तो, यह MLVA और MLST के बीच महत्वपूर्ण अंतर है।
