एनजीएस और डब्ल्यूजीएस के बीच महत्वपूर्ण अंतर यह है कि अगली पीढ़ी की अनुक्रमण (एनजीएस) एक व्यापक समानांतर दूसरी पीढ़ी की अनुक्रमण तकनीक है जो उच्च थ्रूपुट, कम लागत और तेज है, जबकि संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण (डब्ल्यूजीएस) है सेंगर अनुक्रमण, शॉटगन दृष्टिकोण या उच्च थ्रूपुट एनजीएस अनुक्रमण जैसी अनुक्रमण तकनीकों का उपयोग करके एक ही समय में एक सेल के संपूर्ण जीनोमिक डीएनए का विश्लेषण करने की एक व्यापक विधि।
पिछले कुछ दशकों में, तेजी से अनुक्रमण तकनीकों और जैव सूचना विज्ञान उपकरणों की खोज के कारण मनुष्यों और अन्य जानवरों के जीनोम की समझ बड़े पैमाने पर बढ़ी है। पारंपरिक अनुक्रमण तकनीकों जैसे कि सेंगर अनुक्रमण की अपनी सीमाएँ थीं, जिसने अगली पीढ़ी के अनुक्रमण (NGS) और नैनोपोर अनुक्रमण जैसी नई तीव्र अनुक्रमण विधियों के विकास का आह्वान किया।संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण (WGS) तकनीक एक हालिया दृष्टिकोण है जो पहले से ही कई जीनोमिक अनुसंधान परियोजनाओं में उपयोग किया जाता है, जैसे कि जीनोमिक इंग्लैंड, यूके द्वारा 100, 000 जीनोमिक परियोजना। तो, एनजीएस और डब्ल्यूजीएस दो अनुक्रमण विधियां हैं जो वर्तमान में कई जीनोमिक परियोजनाओं में शामिल हैं।
एनजीएस क्या है?
NGS (अगली पीढ़ी की अनुक्रमण) एक व्यापक समानांतर दूसरी पीढ़ी की अनुक्रमण तकनीक है जो उच्च थ्रूपुट, कम लागत और तेज़ है। अगली पीढ़ी के अनुक्रमण के लिए कोई सटीक परिभाषा नहीं है। लेकिन हम इसे पारंपरिक केशिका-आधारित अनुक्रमण तकनीकों से स्पष्ट रूप से अलग कर सकते हैं। अगली पीढ़ी की अनुक्रमण एक एकल प्रयोग में 1 मिलियन बेस पेयर से बड़े कुल आकार वाले डीएनए अणु के अनुक्रमण की अनुमति देता है। यह अभूतपूर्व गति और उच्च थ्रूपुट विकल्प प्रदान करता है, जैसे एक ही समय में कई व्यक्तियों के डीएनए की अनुक्रमण की अनुमति देना। यह व्यक्तिगत अनुक्रमण प्रतिक्रियाओं की मात्रा को छोटा करके प्राप्त किया जाता है। इसके अलावा, यह उपकरणों के आकार को भी सीमित करता है और प्रति प्रतिक्रिया अभिकर्मकों की लागत को कम करता है।
चित्र 01: एनजीएस प्लेटफॉर्म
NGS एक लघु-पठित अनुक्रमण विधि है जिसने पहले ही जैविक अनुसंधान क्षेत्र में क्रांति ला दी है। इसके अलावा, एनजीएस को विभिन्न क्षेत्रों में लागू किया जाता है जैसे डे नोवो जीनोम सीक्वेंसिंग, होल-जीनोम सीक्वेंसिंग, ट्रांसक्रिप्टोम एनालिसिस, स्मॉल आरएनए और माइक्रो आरएनए सीक्वेंसिंग, टारगेटेड रिसेक्वेंसिंग, और होल-एक्सोम सीक्वेंसिंग।
WGS क्या है?
WGS (संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण) अनुक्रमण तकनीकों जैसे सेंगर अनुक्रमण, शॉटगन दृष्टिकोण, या उच्च थ्रूपुट NGS अनुक्रमण का उपयोग करके एक ही समय में एक सेल के संपूर्ण जीनोमिक डीएनए का विश्लेषण करने का एक व्यापक तरीका है। इसे पूर्ण जीनोम अनुक्रमण या पूर्ण जीनोम अनुक्रमण के रूप में भी जाना जाता है। संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण में जीव के सभी गुणसूत्र डीएनए के साथ-साथ माइटोकॉन्ड्रिया में डीएनए और पौधों के लिए, एक ही समय में क्लोरोप्लास्ट में डीएनए का अनुक्रमण होता है।डब्ल्यूजीएस वैज्ञानिकों को उन सभी अक्षरों के सटीक अनुक्रम को पढ़ने में सक्षम बनाता है जो डीएनए का पूरा सेट बनाते हैं। NGS प्लेटफॉर्म का उपयोग करने वाले WGS से क्लिनिकल सेटअप में क्रांति आने की उम्मीद है।
चित्र 02: WGS बनाम पदानुक्रमित शॉटगन अनुक्रमण
2014 में नैदानिक देखभाल के लिए संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण की शुरुआत की गई थी। इसके अलावा, डब्ल्यूजीएस के अनुप्रयोग में एसएनपी स्तर पर जीन अनुक्रमण शामिल है ताकि एसोसिएशन अध्ययनों में कार्यात्मक रूपों को इंगित किया जा सके, व्यक्तिगत चिकित्सा में चिकित्सीय हस्तक्षेप, विकासवादी जीव विज्ञान, तुलनात्मक जीनोमिक विश्लेषण, उत्परिवर्तन और पुनर्व्यवस्था अध्ययन, दुर्लभ प्रकार के संघ अध्ययन, और रोग संवेदनशीलता और दवा प्रतिक्रिया की भविष्यवाणी।
एनजीएस और डब्ल्यूजीएस में क्या समानताएं हैं?
- NGS और WGS दो अनुक्रमण तकनीकें हैं।
- दोनों तकनीक या तो डीएनए या आरएनए को अनुक्रमित करती हैं।
- ये तकनीक नई और विश्वसनीय हैं।
- इन दोनों का उपयोग रोगों के निदान और दवाओं की खोज में किया जाता है।
एनजीएस और डब्ल्यूजीएस में क्या अंतर है?
NGS एक व्यापक समानांतर दूसरी पीढ़ी की अनुक्रमण तकनीक है जो उच्च थ्रूपुट, कम लागत और तेज है, जबकि WGS एक सेल के संपूर्ण जीनोमिक डीएनए का एक ही समय में अनुक्रमण तकनीकों का उपयोग करके विश्लेषण करने का एक व्यापक तरीका है। सेंगर अनुक्रमण, शॉटगन दृष्टिकोण या उच्च थ्रूपुट एनजीएस अनुक्रमण के रूप में। तो, यह NGS और WGS के बीच महत्वपूर्ण अंतर है। इसके अलावा, NGS में केवल दूसरी पीढ़ी की अनुक्रमण विधियाँ होती हैं जबकि WGS में पहली, दूसरी और तीसरी पीढ़ी की अनुक्रमण विधियाँ होती हैं।
निम्न तालिका एक साथ तुलना के लिए तालिका के रूप में और एनजीएस और डब्ल्यूजीएस के बीच अंतर प्रस्तुत करती है।
सारांश - एनजीएस बनाम डब्ल्यूजीएस
पिछले दशकों में, समकालीन आणविक अनुसंधान में विभिन्न अनुक्रमण तकनीकों को नियमित रूप से लागू किया गया है। और यहां तक कि वे कई नैदानिक अनुप्रयोगों के लिए बहुत शक्तिशाली उपकरण हैं। एनजीएस और डब्ल्यूजीएस दो अनुक्रमण विधियां हैं जो वर्तमान में कई जीनोमिक परियोजनाओं में शामिल हैं। एनजीएस दूसरी पीढ़ी की अनुक्रमण तकनीक है जो उच्च थ्रूपुट, कम लागत और तेज है। दूसरी ओर, WGS, सेंगर अनुक्रमण, शॉटगन दृष्टिकोण, या उच्च थ्रूपुट NGS अनुक्रमण जैसी अनुक्रमण तकनीकों का उपयोग करके एक ही समय में संपूर्ण जीनोमिक डीएनए या सेल के पूर्ण जीनोमिक डीएनए का विश्लेषण करने की एक विधि है। तो, यह NGS और WGS के बीच अंतर का सारांश है।
