dNTP और ddNTP के बीच महत्वपूर्ण अंतर यह है कि dNTP या डीऑक्सीराइबोन्यूक्लियोटाइड्स डीएनए के निर्माण खंड हैं और पेंटोस चीनी संरचना पर 3ʹ-OH समूह होते हैं जबकि ddNTP या डिडॉक्सिन्यूक्लियोसाइड ट्राइफॉस्फेट न्यूक्लियोटाइड होते हैं जिनमें 3ʹ-OH समूह की कमी होती है और वे सेंगर डिडॉक्सी डीएनए अनुक्रमण तकनीक में विभिन्न लंबाई के डीएनए अनुक्रम उत्पन्न करने के लिए उपयोग किया जाता है।
dNTP और ddNTP न्यूक्लियोटाइड हैं। डीएनटीपी डीऑक्सीराइबोज न्यूक्लियोटाइड्स को संदर्भित करता है। वे डीएनए के निर्माण खंड हैं। डीएनए को संश्लेषित करने के लिए dNTPs का उपयोग किया जाता है। दूसरी ओर, dNTP, डिडॉक्सिन्यूक्लियोसाइड ट्राइफॉस्फेट को संदर्भित करता है। डीएनए संश्लेषण को अलग-अलग लंबाई में समाप्त करने के लिए उनका उपयोग सेंगर अनुक्रमण में किया जाता है।उनके पास 3ʹ स्थान पर OH समूह की कमी है। हाइड्रोजन OH समूह के स्थान पर 3ʹ की स्थिति में उपस्थित है। इसलिए, ddNTPs अगले न्यूक्लियोटाइड के साथ एक फॉस्फोडाइस्टर बंधन बनाने में असमर्थ हैं। dNTP डीएनए के संश्लेषण को करने में सक्षम है, जबकि ddNTP डीएनए के पोलीमराइजेशन को समाप्त करने में सक्षम है।
dNTP क्या है?
dNTP का मतलब डीऑक्सीराइबोज न्यूक्लियोटाइड या डीऑक्सीराइबोन्यूक्लियोटाइड है। यह डीएनए का बिल्डिंग ब्लॉक है। डीएनटीपी चार प्रकार के होते हैं। वे डीएटीपी, डीटीटीपी, डीसीटीपी और डीजीटीपी हैं। उनका नाम प्यूरीन या पाइरीमिडीन नाइट्रोजनस बेस के अनुसार रखा गया है: एडेनिन (ए), गुआनिन (जी), थाइमिन (टी) और साइटोसिन (सी)।
चित्र 01: dNTP
एडेनिन और ग्वानिन प्यूरीन क्षारक हैं जबकि थाइमिन और साइटोसिन पाइरीमिडीन क्षारक हैं। dNTP की पेन्टोज शर्करा डीऑक्सीराइबोज है।एक फॉस्फेट समूह भी है। इसलिए, dNTP तीन घटकों से बना होता है: एक नाइट्रोजनस बेस, डीऑक्सीराइबोज शुगर और एक फॉस्फेट समूह। ये dNTPs फॉस्फोडाइस्टर बांड के माध्यम से एक दूसरे के साथ जुड़ते हैं। dNTPs में, पेंटोस चीनी की स्थिति 3ʹ से जुड़ा एक OH समूह होता है जिसे अगले न्यूक्लियोटाइड की चीनी के 5ʹ कार्बन से जुड़े फॉस्फेट समूह के साथ एक लिंक बनाने की आवश्यकता होती है। चूंकि सभी dNTPs में यह 3ʹ-OH समूह होता है, वे डीएनए स्ट्रैंड को संश्लेषित और विस्तारित करने में सक्षम होते हैं। इसलिए, dNTP डीएनए और जीन के रासायनिक पदार्थ की मूल दोहराव इकाई के रूप में कार्य करता है। डीएनए का संश्लेषण हमेशा 5ʹ से 3ʹ तक होता है।
डीडीएनटीपी क्या है?
सेंगर अनुक्रमण एक पहली पीढ़ी की डीएनए अनुक्रमण विधि है जिसे 1977 में फ्रेडरिक सेंगर और उनके कॉलेजों द्वारा विकसित किया गया था। इसे चेन टर्मिनेशन सीक्वेंसिंग या डाइडॉक्सी अनुक्रमण के रूप में भी जाना जाता है क्योंकि इस पद्धति का मूल सिद्धांत डिडॉक्सिन्यूक्लियोसाइड ट्राइफॉस्फेट का उपयोग करके श्रृंखला समाप्ति है। (डीडीएनटीपी)। ddNTPs सेंगर अनुक्रमण में उपयोग किए जाने वाले न्यूक्लियोटाइड हैं।सेंगर अनुक्रमण इन विट्रो डीएनए प्रतिकृति के दौरान ddNTPs के चयनात्मक समावेश और डीएनए संश्लेषण की समाप्ति पर आधारित है। ddNTPs की विशेषता यह है कि आसन्न न्यूक्लियोटाइड में 5ʹ के फॉस्फेट समूह के बीच फॉस्फोडाइस्टर बंधन गठन जारी रखने के लिए पेंटोस चीनी पर 3ʹ-OH समूह की कमी होती है। इसलिए, एक बार जब एक ddNTP विस्तारित स्ट्रैंड से जुड़ा होता है, तो श्रृंखला बढ़ाव समाप्त हो जाता है और उस बिंदु से समाप्त हो जाता है। ddNTPs सेंगर अनुक्रमण विधि के दौरान डीएनए पोलीमरेज़ के श्रृंखला-लम्बी अवरोधक के रूप में कार्य करते हैं।
चित्र 02: डीडीएनटीपी
चार ddNTPs हैं: ddATP, ddCTP, ddGTP और ddTTP सेंगर अनुक्रमण में उपयोग किया जाता है। ये न्यूक्लियोटाइड डीएनए प्रतिकृति प्रक्रिया को रोकते हैं जब उन्हें डीएनए के बढ़ते स्ट्रैंड में शामिल किया जाता है। नतीजतन, सेंगर अनुक्रमण अलग-अलग लंबाई के छोटे डीएनए का उत्पादन करता है।केशिका जेल वैद्युतकणसंचलन का उपयोग इन छोटे डीएनए किस्में को उनके आकार के अनुसार जेल पर व्यवस्थित करने के लिए किया जाता है। डीएनए अनुक्रम के विश्लेषण में आसानी के लिए ddNTPs को रेडियोधर्मी या फ्लोरोसेंट रूप से विभिन्न रंगों के साथ लेबल किया जाता है। जेल का विश्लेषण करके, अज्ञात डीएनए स्ट्रैंड के न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम को निर्धारित किया जा सकता है।
dNTP और DdNTP में क्या समानता है?
- dNTP और ddNTP दोनों का उपयोग सेंगर अनुक्रमण में किया जाता है।
- dNTPs और ddNTPs चार प्रकार के होते हैं।
- वे तीन घटकों से बने होते हैं: एक नाइट्रोजनस बेस, डीऑक्सीराइबोज शुगर और फॉस्फेट समूह।
dNTP और DdNTP में क्या अंतर है?
dNTP चार प्रकार के डीऑक्सीराइबोन्यूक्लियोटाइड्स में से एक है जो डीएनए के निर्माण खंड हैं। ddNTP सेंगर अनुक्रमण तकनीक में उपयोग किए जाने वाले चार प्रकार के डिडॉक्सिराइबोन्यूक्लियोसाइड ट्राइफॉस्फेट में से एक है। dNTP में पेंटोस शुगर पर 3ʹ-OH समूह होता है जबकि ddNTP में पेंटोस शुगर पर 3ʹ-OH समूह का अभाव होता है।इस प्रकार, यह dNTP और ddNTP के बीच महत्वपूर्ण अंतर है। इसके अलावा, dNTPs डीएनए पोलीमराइज़ेशन करते हैं जबकि ddNTPs डीएनए पोलीमराइज़ेशन को समाप्त करते हैं। इसलिए, यह dNTP और ddNTP के बीच एक और बड़ा अंतर है।
नीचे दिए गए इन्फोग्राफिक में dNTP और ddNTP के बीच अंतर को सारणीबद्ध रूप में सूचीबद्ध किया गया है।
सारांश – डीएनटीपी बनाम डीडीएनटीपी
सामान्य dNTPs डीएनए के निर्माण खंड हैं जबकि ddNTPs सेंगर अनुक्रमण तकनीक में उपयोग किए जाने वाले न्यूक्लियोटाइड हैं। dNTP में 3ʹ-OH है जबकि ddNTP में 3ʹ-OH का अभाव है। इस प्रकार, यह dNTP और ddNTP के बीच महत्वपूर्ण अंतर है। इसके अलावा, dNTP डीएनए स्ट्रैंड को संश्लेषित कर सकता है जबकि ddNTP डीएनए पोलीमराइजेशन को समाप्त कर सकता है। इसलिए, अलग-अलग लंबाई के साथ अलग-अलग डीएनए स्ट्रैंड का उत्पादन करने के लिए सेंगर अनुक्रमण में ddNTPs का उपयोग किया जाता है। सेंगर अनुक्रमण के दौरान, dNTP और ddNTP दोनों शामिल हैं।