श्रेणीबद्ध और संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण के बीच महत्वपूर्ण अंतर यह है कि पदानुक्रमित शॉटगन अनुक्रमण में, जीनोम अनुक्रमण से पहले बड़े टुकड़ों में टूट जाता है, जबकि पूरे जीनोम शॉटगन अनुक्रमण में, संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण के लिए छोटे टुकड़ों में टूट जाता है।.
अनुक्रमण आणविक प्रक्रियाओं में एक महत्वपूर्ण तकनीक है, विशेष रूप से प्रजातियों की सटीक पहचान में। वास्तव में, यह जीन या जीनोम में न्यूक्लियोटाइड के सटीक क्रम की पहचान करने की तकनीक है। अनुक्रमण के लिए कई तकनीकें हैं। इनमें से कुछ में मैक्सम गिल्बर्ट मेथड, सेंगर मेथड और ऑटोमेटेड सेंगर मेथड शामिल हैं।
श्रेणीबद्ध शॉटगन अनुक्रमण क्या है?
श्रेणीबद्ध शॉटगन अनुक्रमण अनुक्रमण की एक विधि है। इसे 'टॉप-डाउन सीक्वेंसिंग' भी कहा जाता है। इसके अलावा, इस पद्धति में दो चरण होते हैं: पहला चरण जीनोम प्रवर्धन है, और दूसरा चरण जीनोम विखंडन है। इस पद्धति में, जीनोम को पहले बड़े टुकड़ों में काट दिया जाता है। इसके बाद वैक्टर या कृत्रिम गुणसूत्रों का उपयोग करके इन बड़े टुकड़ों को विभिन्न मेजबानों में क्लोन किया जाता है। फिर, इन पुनः संयोजक सदिशों को एक पुस्तकालय में व्यवस्थित किया जाता है। शॉटगन अनुक्रमण के दौरान, पुनः संयोजक वेक्टर क्लोन व्यक्तिगत रूप से अनुक्रमण से गुजरते हैं। क्लोन के टुकड़े जीनोम के आकार को और कम करने के लिए प्रतिबंध पाचन से गुजरते हैं, जिससे अनुक्रमण होता है।
चित्र 01: श्रेणीबद्ध शॉटगन अनुक्रमण
श्रेणीबद्ध शॉटगन अनुक्रमण के दौरान, शॉटगन अनुक्रमण से पहले टुकड़ों के बड़े टुकड़ों को क्रम में व्यवस्थित करना पड़ता है। यह आणविक मार्करों की सहायता से होता है जिन्हें क्लोनिंग प्रक्रिया के दौरान शामिल किया जाता है।
श्रेणीबद्ध शॉटगन अनुक्रमण एक कम-रिज़ॉल्यूशन जीन मानचित्र बनाता है। लेकिन यह एक क्रमबद्ध अनुक्रम मानचित्र बनाता है। इस प्रकार, प्रत्यक्ष अनुक्रमण की तुलना में इसमें अधिक समय लगता है। एक पुनः संयोजक वेक्टर पुस्तकालय के निर्माण के कारण पूरी प्रक्रिया में देरी होती है। क्या यह भी एक श्रमसाध्य तकनीक है। हालाँकि, वर्तमान में, काम को आसान बनाने के लिए तकनीक स्वचालित है।
संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण क्या है?
संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण एक एकल चरण अनुक्रमण प्रक्रिया है। इस प्रक्रिया में सबसे पहले पूरे जीनोम का शियरिंग होता है। इसके बाद, इन छोटे टुकड़ों में से प्रत्येक यादृच्छिक रूप से अनुक्रमित होता है। अनुक्रमण के पूरा होने पर, अनुक्रम विश्लेषण होता है।अनुक्रम विश्लेषण के दौरान, अतिव्यापी अनुक्रम हटा दिए जाते हैं, और विश्लेषण एक आदेशित प्रक्रिया नहीं है। इसलिए, पदानुक्रमित बन्दूक अनुक्रमण की तुलना में अनुक्रमों का संयोजन एक कम कुशल प्रक्रिया है। हालाँकि, संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण की प्रक्रिया अधिक तेज़ है, और पूरे जीनोम का विश्लेषण एक ही बार में हो सकता है।
पदानुक्रमित और संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण के बीच समानताएं क्या हैं?
- पदानुक्रमित और संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण दो अनुक्रमण दृष्टिकोण हैं।
- दोनों सेंगर अनुक्रमण या स्वचालित सेंगर अनुक्रमण विधियों से गुजरते हैं।
- वे डीएनए और आरएनए अंशों के अनुक्रमण में शामिल हैं।
- इसके अलावा, आणविक निदान और अनुसंधान उद्देश्यों में दोनों विधियां महत्वपूर्ण हैं।
- वर्तमान में, दोनों तकनीकें स्वचालित या कंप्यूटर आधारित हैं।
- दोनों तकनीक जीनोम के विखंडन पर निर्भर करती है।
पदानुक्रमित और संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण में क्या अंतर है?
श्रेणीबद्ध शॉटगन अनुक्रमण पूरे-जीनोम शॉटगन अनुक्रमण की तुलना में बड़े आकार के टुकड़े उत्पन्न करता है, जो अनुक्रमों के छोटे टुकड़ों के साथ काम करता है। तो, यह पदानुक्रमित और संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण के बीच महत्वपूर्ण अंतर है। इसके अलावा, पदानुक्रमित शॉटगन अनुक्रमण में दो प्रमुख चरण होते हैं, जबकि संपूर्ण-जीनोम शॉटगन अनुक्रमण एक प्रमुख चरण पर निर्भर करता है।
इसके अलावा, पदानुक्रमित और संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण के बीच एक और अंतर यह है कि पदानुक्रमित शॉटगन अनुक्रमण की तुलना में संपूर्ण-जीनोम शॉटगन अनुक्रमण में रिज़ॉल्यूशन अधिक है।
नीचे दिया गया इन्फोग्राफिक पदानुक्रमित और संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण के बीच अंतर को सारांशित करता है।
सारांश - पदानुक्रमित बनाम संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण
श्रेणीबद्ध और संपूर्ण-जीनोम शॉटगन अनुक्रमण बड़े जीनोम अनुक्रमित करने की दो तकनीकें हैं। पदानुक्रमित शॉटगन अनुक्रम अनुक्रमण की एक दो-चरणीय प्रक्रिया है जहां जीनोम बड़े टुकड़ों में टूट जाता है। इसके विपरीत, संपूर्ण-जीनोम शॉटगन अनुक्रमण एक एकल चरण अनुक्रमण है जहां जीनोम को छोटे टुकड़ों में तोड़ दिया जाता है और सीधे अनुक्रमित किया जाता है। इस प्रकार, यह पदानुक्रमित और संपूर्ण जीनोम शॉटगन अनुक्रमण के बीच महत्वपूर्ण अंतर है। इसके अलावा, तकनीकी पहलू दो तकनीकों के बीच भिन्न हो सकते हैं।
