मुख्य अंतर - एक्सोम बनाम ट्रांसक्रिप्टोम
एक जीन में कोडिंग और गैर-कोडिंग क्षेत्र होते हैं। कोडिंग अनुक्रमों को एक्सॉन के रूप में जाना जाता है, और गैर-कोडिंग अनुक्रमों को इंट्रॉन के रूप में जाना जाता है। जीन के एक्सॉन का न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम विशिष्ट प्रोटीन को संश्लेषित करने के लिए जीन के आनुवंशिक कोड का प्रतिनिधित्व करता है। इसलिए, एक्सॉन mRNA अणु में रहते हैं। जीनोम के कुल एक्सॉन क्षेत्र को एक्सोम के रूप में जाना जाता है, और यह जीनोम का एक महत्वपूर्ण हिस्सा है। जीन का आनुवंशिक कोड mRNA अणु के आनुवंशिक कोड में परिवर्तित हो जाता है, जो प्रोटीन के उत्पादन के लिए आवश्यक होता है। एक समय में एक सेल या सेल आबादी में संचरित पूरे एमआरएनए अणुओं को एक प्रतिलेख के रूप में जाना जाता है।एक्सोम और ट्रांसक्रिप्टोम के बीच महत्वपूर्ण अंतर यह है कि एक्सोम जीनोम के एक्सॉन क्षेत्रों के अनुक्रमों का प्रतिनिधित्व करता है जबकि ट्रांसक्रिपटॉम एक निश्चित समय में सेल या ऊतक के कुल एमआरएनए का प्रतिनिधित्व करता है।
एक्सोम क्या है?
जीन एक्सॉन, इंट्रोन्स और नियामक अनुक्रमों से बने होते हैं। एक्सॉन जीन क्षेत्र हैं जो प्रतिलेखन के दौरान एमआरएनए अनुक्रम में लिखे जाते हैं। ट्रांसक्रिप्शन के दौरान इंट्रोन्स और अन्य गैर-कोडिंग क्षेत्रों को हटा दिया जाता है। एक्सॉन का न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम जीन के आनुवंशिक कोड को निर्धारित करता है जो विशिष्ट प्रोटीन को कोडित करता है। एक प्रोटीन के mRNA के भीतर केवल एक्सॉन रहते हैं। जीनोम में एक्सॉन के संग्रह को जीव के एक्सोम के रूप में जाना जाता है। यह जीनोम के एक हिस्से का प्रतिनिधित्व करता है जो जीन में व्यक्त किया जाता है। मनुष्यों में, एक्सोम जीनोम से 1% खाता है। यह मानव जीनोम का प्रोटीन-कोडिंग भाग है।
चित्र 01: Exome
प्रतिलेख क्या है?
प्रतिलेख किसी दिए गए ऊतक में सभी प्रोटीन-कोडिंग और गैर-कोडिंग टेप (आरएनए) का संग्रह है। ट्रांसक्रिप्टोम एक सेल या ऊतक में जीन द्वारा व्यक्त कुल एमआरएनए अणुओं के संग्रह का प्रतिनिधित्व करता है। एक कोशिका का प्रतिलेख दूसरे प्रकार की कोशिका के प्रतिलेख के साथ भिन्न हो सकता है। प्रतिलेख भी गतिशील है - यह आंतरिक और बाहरी दोनों उत्तेजनाओं के जवाब में समय के साथ बदलता है। एक ही ऊतक के भीतर या एक ही प्रकार की कोशिका के भीतर भी, ट्रांसक्रिप्टोम कुछ मिनटों के बाद बदल सकता है।
प्रतिलेख जीव के एक्सोम से भिन्न होता है। ट्रांसक्रिप्टोम में केवल व्यक्त एक्सोम सीक्वेंस शामिल हैं। यद्यपि एक कोशिका का एक्सोम समान रहता है, कोशिकाओं के बीच प्रतिलेख भिन्न होता है क्योंकि सभी कोशिकाओं या ऊतकों के लिए जीन अभिव्यक्ति समान नहीं होती है। विभिन्न कोशिकाओं और ऊतकों में केवल आवश्यक जीन ही व्यक्त किए जाते हैं।जीन अभिव्यक्ति एक ऊतक या कोशिका प्रकार विशिष्ट प्रक्रिया है। यह पर्यावरणीय कारकों सहित विभिन्न कारकों द्वारा नियंत्रित होता है। इसलिए, ट्रांसक्रिप्टोम बाहरी पर्यावरणीय परिस्थितियों के साथ भिन्न हो सकते हैं।
ट्रांसक्रिप्टोम का उपयोग प्रोटिओमिक्स अध्ययन के लिए एक अग्रदूत के रूप में किया जाता है। सभी प्रोटीन mRNA अनुक्रम से प्राप्त होते हैं। अनुवाद संबंधी संशोधनों के परिणामस्वरूप प्रोटीन में परिवर्तन हो सकते हैं। हालांकि, ट्रांसक्रिपटॉम प्रोटिओमिक अध्ययन के लिए महत्वपूर्ण बुनियादी जानकारी प्रदान करता है।
चित्र 02: भ्रूणीय स्टेम कोशिकाओं का प्रतिलेख
एक्सोम और ट्रांसक्रिप्टोम में क्या अंतर है?
एक्सोम बनाम ट्रांसक्रिप्टोम |
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| एक्सोम जीन के प्रोटीन-कोडिंग क्षेत्र का संग्रह है। | ट्रांसक्रिपटोम एमआरएनए सहित सभी लिखित आरएनए का संग्रह है। |
| नमूना | |
| डीएनए नमूने का उपयोग करके एक्सोम का अध्ययन किया जाता है। | प्रतिलेखन का अध्ययन आरएनए नमूने का उपयोग करके किया जाता है। |
| अध्ययन विधि | |
| पूरे एक्सोम सीक्वेंसिंग एक्सोम का अध्ययन करने की विधि है। | आरएनए अनुक्रमण प्रतिलेख का अध्ययन करने की विधि है। |
सारांश - एक्सोम बनाम ट्रांसक्रिप्टोम
एक्सॉन जीन के कोडिंग अनुक्रम हैं और प्रोटीन के एमआरएनए अनुक्रम निर्धारित करते हैं। इन कोडिंग अनुक्रमों (एक्सॉन) के संग्रह को जीव के एक्सोम के रूप में जाना जाता है। प्रोटीन बनाने से पहले जीन को एमआरएनए अणुओं में स्थानांतरित किया जाता है। किसी भी समय किसी कोशिका या ऊतक के कुल mRNA अणुओं को प्रतिलेख के रूप में जाना जाता है।ट्रांसक्रिप्टोम उन जीनों का प्रतिनिधित्व करता है जिन्हें किसी भी समय सक्रिय रूप से एमआरएनए में व्यक्त किया जा रहा है। ट्रांसक्रिप्टोम कोशिका और ऊतक विशिष्ट है और पर्यावरणीय परिस्थितियों को प्रभावित करता है। एक्सोम और ट्रांसक्रिप्टोम में यही अंतर है।
