ब्लास्ट और फास्टा के बीच मुख्य अंतर यह है कि ब्लास्ट एक बुनियादी संरेखण उपकरण है जो नेशनल सेंटर फॉर बायोटेक्नोलॉजी इंफॉर्मेशन वेबसाइट पर उपलब्ध है, जबकि फास्टए एक समानता खोज उपकरण है जो यूरोपीय जैव सूचना विज्ञान संस्थान की वेबसाइट पर उपलब्ध है।
BLAST और FastA दो सॉफ्टवेयर हैं जो विभिन्न प्रजातियों के डीएनए, अमीनो एसिड, प्रोटीन और न्यूक्लियोटाइड के जैविक अनुक्रमों की तुलना करने और उनकी समानता की तलाश करने के लिए व्यापक रूप से उपयोग में हैं। ये एल्गोरिदम गति को ध्यान में रखते हुए लिखे गए थे। क्योंकि, जब वैज्ञानिक 1980 के दशक के मध्य में प्रयोगशाला में डीएनए को अलग करने में सक्षम थे, तो इसने उच्च गति पर आगे के शोध के लिए समान जीन की तुलना करने और खोजने की आवश्यकता को उठाया।इसलिए, इन दो सॉफ़्टवेयरों को इस तरह से विकसित किया गया था कि उपयोगकर्ता अपने क्वेरी अनुक्रमों के समान अनुक्रमों की तेज़ी से खोज कर सकें।
BLAST बेसिक लोकल एलाइनमेंट सर्च टूल का संक्षिप्त रूप है और दो अनुक्रमों की तुलना करने में स्थानीय दृष्टिकोण का उपयोग करता है। FastA एक सॉफ्टवेयर है जो Fast A को संदर्भित करता है जहां A का अर्थ सभी है। यहां, सॉफ्टवेयर डीएनए अनुक्रमण के लिए फास्ट ए और प्रोटीन के लिए फास्ट पी जैसे अक्षरों के साथ काम करता है। BLAST और FastA दोनों किसी भी जीनोम डेटाबेस की तुलना करने में बहुत तेज़ हैं और इसलिए, आर्थिक रूप से और साथ ही समय बचाने में बहुत व्यवहार्य हैं।
विस्फोट क्या है?
BLAST सबसे व्यापक रूप से उपयोग किए जाने वाले जैव सूचना विज्ञान सॉफ्टवेयर में से एक है जिसे 1990 में विकसित किया गया था। तब से, यह NCBI साइट पर सभी के लिए उपलब्ध है। इसके अलावा, कोई भी व्यक्ति इस सॉफ़्टवेयर का उपयोग कर सकता है और इसका उपयोग कर सकता है। इसके अलावा, BLAST एक ऐसा सॉफ्टवेयर है जिसे FastA प्रारूप में इनपुट डेटा या अनुक्रम की आवश्यकता होती है। लेकिन, यह आउटपुट डेटा को प्लेन टेक्स्ट, HTML या XML फॉर्मेट में देता है। BLAST दो अनुक्रमों के बीच स्थानीय समानताओं की खोज करने के सिद्धांत पर काम करता है और समान अनुक्रमों को संक्षिप्त सूची में रखता है, और उसके बाद, यह पड़ोस समानताओं की खोज करता है।
चित्र 01: ब्लास्ट परिणाम
इस प्रकार, यह सॉफ़्टवेयर समान स्थानीय क्षेत्रों की एक बड़ी संख्या की खोज करता है और थ्रेशोल्ड मान तक पहुंचने पर परिणाम देता है। हालाँकि, यह प्रक्रिया पहले के सॉफ़्टवेयर से भिन्न है, जो पहले पूरे अनुक्रम को खोजता है और फिर तुलना करता है, और इसलिए, इसमें बहुत समय लगता है।
उपरोक्त समानता जांच के अलावा, BLAST के कई अन्य उपयोग हैं जैसे डीएनए मैपिंग, विभिन्न प्रजातियों में दो समान जीनों की तुलना करना, एक फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ बनाना, आदि।
फास्टए क्या है?
फास्टा एक प्रोटीन सीक्वेंस अलाइनमेंट सॉफ्टवेयर है। डेविड जे. लिपमैन और विलियम आर. पियर्सन ने 1985 में इस सॉफ़्टवेयर का वर्णन किया। हालांकि इस सॉफ़्टवेयर का प्रारंभिक उपयोग केवल प्रोटीन अनुक्रमों की तुलना करने के लिए किया गया था, इसका संशोधित संस्करण डीएनए अनुक्रमों की तुलना करने में भी सक्षम था।यहां, यह सॉफ्टवेयर सांख्यिकीय रूप से दो अनुक्रमों के बीच समानता खोजने के सिद्धांत का उपयोग करता है। यह स्थानीय अनुक्रम संरेखण विधि द्वारा डीएनए या प्रोटीन के एक अनुक्रम को दूसरे अनुक्रम से मिलाता है।
चित्र 02: फास्टए
हालांकि, यह समानता के लिए स्थानीय क्षेत्रों की खोज करता है, लेकिन दो अनुक्रमों के बीच सर्वश्रेष्ठ मिलान नहीं। चूंकि यह सॉफ़्टवेयर कई बार स्थानीय समानताओं की तुलना करता है, इसलिए यह बेमेल के साथ भी आ सकता है। एक क्रम में, FastA एक छोटा सा हिस्सा लेता है जिसे k-tuples के रूप में जाना जाता है, जहाँ tuples 1 से 6 तक हो सकता है और दूसरे क्रम के k-tuples के साथ मेल खाता है। मिलान प्रक्रिया के अंत में, जब यह थ्रेशोल्ड मान तक पहुँच जाता है, तो यह परिणाम उत्पन्न करता है।
ब्लास्ट और फास्टा में क्या समानताएं हैं?
- BLAST और FastA जैव सूचना विज्ञान उपकरण हैं जिनका उपयोग समानता के लिए प्रोटीन और डीएनए अनुक्रमों की तुलना करने के लिए किया जाता है।
- साथ ही, दोनों प्रोग्राम अनुक्रमों के बीच तुलना करने के लिए स्कोरिंग रणनीति का उपयोग करते हैं।
- इसके अलावा, दोनों उपकरण अत्यधिक सटीक परिणाम देते हैं।
ब्लास्ट और फास्टा में क्या अंतर है?
BLAST जैविक अनुक्रमों के बीच समानता की जांच करने का एक उपकरण है। दूसरी ओर, FastA एक अन्य कार्यक्रम है जो प्रोटीन और डीएनए अनुक्रमों की समानता जाँच की सुविधा प्रदान करता है। हालाँकि, FastA की तुलना में, BLAST सॉफ़्टवेयर बहुत लोकप्रिय है क्योंकि यह अधिक सटीक और तेज़ परिणाम देता है। इसलिए, यह ब्लास्ट और फास्टा के बीच का अंतर है। इसके अलावा, FastA के विपरीत, BLAST प्रोग्राम उपयोगकर्ता की आवश्यकता के अनुसार संशोधित किया जा सकता है। इसलिए, यह ब्लास्ट और फास्टा के बीच एक और अंतर है।
ब्लास्ट और फास्टा के बीच अंतर पर नीचे दिया गया इन्फोग्राफिक अधिक विवरण प्रदान करता है।
सारांश – ब्लास्ट बनाम फास्टए
BLAST और FastA दो प्रोग्राम हैं जो उपयोगकर्ता को मौजूदा डेटाबेस में अनुक्रमों के साथ अपने क्वेरी अनुक्रम की तुलना करने और समानता की जांच करने की अनुमति देते हैं। FastA का प्रारंभिक उद्देश्य केवल प्रोटीन अनुक्रमों की तुलना करना था। लेकिन, इस सॉफ्टवेयर का संशोधित संस्करण प्रोटीन और डीएनए अनुक्रम तुलना दोनों की सुविधा प्रदान करता है। हालांकि FastA अच्छा सॉफ्टवेयर है, अधिकांश लोग BLAST संरेखण उपकरण का उपयोग करते हैं क्योंकि यह अधिक लोकप्रिय है और FastA की तुलना में अधिक सटीक और तेज़ परिणाम देता है। साथ ही, BLAST टूल को उपयोगकर्ता की आवश्यकताओं के अनुसार संशोधित किया जा सकता है। संक्षेप में, यह BLAST और FastA के बीच के अंतर को सारांशित करता है।
