ITS1 और ITS2 में क्या अंतर है

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ITS1 और ITS2 में क्या अंतर है
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ITS1 और ITS2 के बीच मुख्य अंतर यह है कि ITS1 यूकेरियोट्स में 18S और 5.8S rRNA जीन के बीच स्थित स्पेसर डीएनए है, जबकि ITS2 यूकेरियोट्स में 5.8S और 28S rRNA जीन के बीच स्थित स्पेसर डीएनए है।

आंतरिक ट्रांस्क्राइब्ड स्पेसर (ITS) स्पेसर डीएनए है जो आमतौर पर छोटे सबयूनिट राइबोसोमल आरएनए और क्रोमोसोम में बड़े सबयूनिट राइबोसोमल आरएनए जीन के बीच या पॉलीसिस्ट्रोनिक आरआरएनए अग्रदूत ट्रांसक्रिप्ट अणु में संबंधित ट्रांसक्रिप्टेड क्षेत्र में स्थित होता है। बैक्टीरिया और आर्किया में, 16S और 23S rRNA जीन के बीच केवल एक ही ITS होता है। लेकिन यूकेरियोट्स में, दो ITS स्पेसर डीएनए होते हैं: ITS1 (18S और 5 के बीच)।8S rRNA जीन) और ITS2 (5.8S और 28S rRNA के बीच)। इसलिए, ITS1 और ITS2 यूकेरियोट्स में rRNA जीन के बीच पाए जाने वाले दो स्पेसर डीएनए हैं।

ITS1 क्या है?

ITS1 यूकेरियोट्स में 18S और 5.8S rRNA जीन के बीच स्थित एक स्पेसर डीएनए है। ITS rRNA जीन के बीच स्थित गैर-कार्यात्मक स्पेसर डीएनए के एक टुकड़े को संदर्भित करता है। ITS1 की लंबाई ITS2 की तुलना में अधिक है। ITS1 की लंबाई भिन्नता लगभग (200-300bp) है। ITS1 जैसे ITS मार्करों ने विभिन्न टैक्सों के बीच फ़ाइलोजेनेटिक संबंधों को स्पष्ट करने में अपनी दक्षता साबित की है। इसके अलावा, ITS1 स्पेसर डीएनए ITS2 स्पेसर डीएनए की तुलना में कम संरक्षित है। ITS1 संरचनाएं केवल बहुत छोटी टैक्सोनॉमिक इकाइयों में संरक्षित हैं। प्रत्येक यूकेरियोटिक राइबोसोमल क्लस्टर में बाहरी ट्रांसक्राइब्ड स्पेसर (5' और 3' ETS) नामक क्षेत्र भी होते हैं।

ITS1 बनाम ITS2
ITS1 बनाम ITS2

चित्र 01: ITS1 क्षेत्र

आईटीएस1 स्पेसर डीएनए 5'बाहरी लिखित स्पेसर (5' ईटीएस) के बहुत करीब है। इसके अलावा, यदि कोई फ़ाइलोजेनेटिक संबंध अध्ययन के लिए ITS1 क्षेत्र को बढ़ाना चाहता है, तो उन्हें इस उद्देश्य के लिए एक विशिष्ट प्राइमर जोड़ी (रिवर्स और फॉरवर्ड प्राइमर) का उपयोग करना होगा। ITS1 क्षेत्र को बढ़ाने के लिए, दो प्राइमर सेट सामान्य रूप से प्रयोगशालाओं के पीसीआर प्रोटोकॉल में उपयोग किए जाते हैं। वे ITS1 फॉरवर्ड और ITS2 रिवर्स या ITS1 फॉवर्ड और ITS4 रिवर्स हैं।

ITS2 क्या है?

ITS2 यूकेरियोट्स में 5.8S और 28S rRNA जीन के बीच स्थित एक स्पेसर डीएनए है। ITS2 क्षेत्र की लंबाई ITS1 क्षेत्र की तुलना में कम है। ITS2 की लंबाई भिन्नता लगभग (180-240bp) है। हालाँकि, ITS2 क्षेत्र कई टैक्सोनॉमिक इकाइयों में ITS1 क्षेत्र की तुलना में अधिक संरक्षित है। यह पहचानता है कि सभी ITS2 अनुक्रम माध्यमिक संरचना का एक सामान्य कोर साझा करते हैं। इसके अलावा, 40% ITS2 क्षेत्र सभी एंजियोस्पर्मों के बीच संरक्षित है, जबकि ITS2 क्षेत्र के 50% को परिवार और उच्च स्तर पर संरेखित करना संभव है।

ITS1 और ITS2 - अंतर
ITS1 और ITS2 - अंतर

चित्र 02: ITS2 क्षेत्र

संरक्षण के दायरे की परवाह किए बिना, ITS2 क्षेत्र का उपयोग भी बहुत लोकप्रिय है जैसे कि ITS1 क्षेत्र फ़ाइलोजेनेटिक संबंध अध्ययनों में, विशेष रूप से कवक डीएनए बारकोडिंग में। ITS2 क्षेत्र को बढ़ाने के लिए, एक विशिष्ट प्राइमर सेट आमतौर पर प्रयोगशालाओं के पीसीआर प्रोटोकॉल में उपयोग किया जाता है। यानी ITS1 आगे और ITS4 रिवर्स। लेकिन जब पीसीआर प्रोटोकॉल इस प्राइमर सेट का उपयोग करता है, तो यह ITS1 क्षेत्र के साथ ITS2 क्षेत्र को भी बढ़ाता है। इसके अलावा, ITS2 स्पेसर डीएनए 3'बाहरी लिखित स्पेसर (3' ETS) के बहुत करीब है।

ITS1 और ITS2 के बीच समानताएं

  • ITS1 और ITS2 rRNA जीन के बीच स्थित दो स्पेसर डीएनए हैं।
  • वे केवल यूकेरियोट्स में मौजूद हैं।
  • दोनों को विशिष्ट प्राइमर जोड़े का उपयोग करके बढ़ाया जा सकता है।
  • वे दोनों गैर-कार्यात्मक उप-उत्पादों के रूप में rRNA परिपक्वता में उत्सर्जित होते हैं।
  • दोनों फाइलोजेनेटिक संबंध अध्ययन के लिए बहुत महत्वपूर्ण हैं, विशेष रूप से कवक डीएनए बारकोडिंग में।

आईटीएस1 और आईटीएस2 के बीच अंतर

ITS1 यूकेरियोट्स में 18S और 5.8S rRNA जीन के बीच मौजूद एक स्पेसर डीएनए है जबकि ITS2 यूकेरियोट्स में 5.8S और 28S rRNA जीन के बीच स्थित एक स्पेसर डीएनए है। तो, यह ITS1 और ITS2 के बीच महत्वपूर्ण अंतर है। इसके अलावा, ITS1 की लंबाई ITS2 की तुलना में अधिक है। दूसरी ओर, ITS2 की लंबाई ITS1 की तुलना में कम है। यह ITS1 और ITS2 के बीच एक और अंतर है।

नीचे दिए गए इन्फोग्राफिक में ITS1 और ITS2 के बीच अंतर को एक साथ तुलना के लिए सारणीबद्ध रूप में सूचीबद्ध किया गया है।

सारांश – ITS1 बनाम ITS2

आंतरिक संचरित क्षेत्र (ITS) rRNA जीन के बीच स्थित स्पेसर डीएनए का एक गैर-कार्यात्मक टुकड़ा है। बैक्टीरिया और आर्किया में, केवल एक ही ITS क्षेत्र होता है।लेकिन यूकेरियोट्स में, दो ITS क्षेत्र हैं: ITS1 और ITS2। ITS1 एक स्पेसर डीएनए है जो यूकेरियोट्स में 18S और 5.8S rRNA जीन के बीच स्थित है, जबकि ITS2 एक स्पेसर डीएनए है जो यूकेरियोट्स में 5.8S और 28S rRNA जीन के बीच स्थित है। इस प्रकार, यह ITS1 और ITS2 के बीच अंतर का सारांश है।

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