यूपीजीएमए और पड़ोसी जॉइनिंग ट्री के बीच मुख्य अंतर प्रत्येक विधि से उत्पन्न होने वाले फ़ाइलोजेनेटिक ट्री के प्रकार का है। UPGMA जड़ वाले फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ के निर्माण की तकनीक है, जबकि पड़ोसी से जुड़ने वाला पेड़ एक बिना जड़ वाले फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ के निर्माण की तकनीक है।
Pylogenetic पेड़ पेड़ की तरह के चित्र हैं जो जीवों के बीच विकासवादी संबंधों को दर्शाते हैं। पेड़ के निर्माण के लिए उपयोग की जाने वाली तकनीक के आधार पर एक फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ में विभिन्न टोपोलॉजी हो सकते हैं। UPGMA और पड़ोसी पेड़ से जुड़ना दो मुख्य विधियाँ हैं जो फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ों का निर्माण करती हैं।
यूपीजीएमए क्या है?
जैव सूचना विज्ञान में विभिन्न क्लस्टरिंग तकनीकें हैं। UPGMA का मतलब अनवीटेड पेयर ग्रुप मेथड और अरिथमेटिक मीन है। यह एक श्रेणीबद्ध समूहन विधि है। विधि सोकल और माइकनर द्वारा पेश की गई थी। यह सबसे तेज़ तकनीक है जो एक फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ विकसित करती है। परिणामी phylogenetic पेड़ एक सामान्य पूर्वज के साथ एक जड़ वाले phylogenetic पेड़ है।
यूपीजीएमए पद्धति का उपयोग करते हुए एक फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ बनाते समय, यह सभी वंशों के लिए विकास दर को समान मानता है। इस प्रकार, यह UPGMA तकनीक में बनाई गई एक महत्वपूर्ण धारणा है। हालाँकि, यह तकनीक का मुख्य दोष भी है क्योंकि वृक्ष निर्माण के दौरान उत्परिवर्तन दर पर विचार नहीं किया जाता है। इसके बजाय, यह उत्परिवर्तन दर को स्थिर मानता है। इसके अलावा, इस परिकल्पना को "आणविक घड़ी परिकल्पना" कहा जाता है। इसलिए, वास्तविक संदर्भ में, UPGMA पद्धति से निर्मित फ़ाइलोजेनेटिक ट्री सटीक और विश्वसनीय नहीं हो सकता है।
चित्र 01: यूपीजीएमए से खींचा गया एक फाइलोजेनेटिक ट्री
यूपीजीएमए विधि एक फाईलोजेनेटिक पेड़ बनाने के लिए जोड़ी-वार दूरियों पर विचार करती है। प्रारंभ में, प्रत्येक प्रजाति एक समूह है, और सबसे छोटी विकासवादी दूरी वाले दो ऐसे समूह एक जोड़ी बनाते हैं। इसलिए, यह दूरी मैट्रिक्स पर निर्भर करता है। एल्गोरिथम व्यंजक UPGMA पद्धति का उपयोग करके तैयार किए गए फ़ाइलोजेनेटिक ट्री के डेटा की व्याख्या करने में एक प्रमुख भूमिका निभाते हैं।
पड़ोसी के पेड़ से जुड़ना क्या है?
पड़ोसी जॉइनिंग ट्री एक अन्य क्लस्टरिंग तकनीक है जिसका उपयोग फ़ाइलोजेनेटिक ट्री बनाने के लिए किया जाता है। नारुया सैतो और मासातोशी नेई इस पद्धति को पेश करने में अग्रणी थे। तकनीक UPGMA के विपरीत एक बिना जड़ वाले पेड़ का उत्पादन करती है। इसके अलावा, इस पद्धति में क्लस्टरिंग अल्ट्रामेट्रिक दूरियों पर निर्भर नहीं करती है। हालांकि, यह फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ का निर्माण करते समय विकास दर की भिन्नता पर विचार करता है।इस प्रकार, इस तकनीक का उपयोग करके खींचे गए पेड़ों में भिन्नताएं हैं। इसलिए, यह विधि उन विविधताओं का आकलन करने के लिए विशेष गणितीय एल्गोरिदम का उपयोग करती है।
चित्र 02: नेबर जॉइनिंग मेथड से खींचा गया एक फाइलोजेनेटिक ट्री
पेड़ों का निर्माण करते समय, यह विधि प्रत्येक वंश के बीच की दूरियों को अलग-अलग मानती है। प्रत्येक वंश वृक्ष में नवनिर्मित नोड से जुड़ता है। ये सभी नोड केंद्रीय नोड से जुड़ते हैं। इसलिए, जब एक नया नोड दिखाई देता है, तो केंद्रीय नोड से नए नोड तक की दूरी महत्वपूर्ण होती है और इसकी गणना एल्गोरिदम का उपयोग करके की जाती है। ये एल्गोरिथम डेटा नए नोड का स्थान तय करते हैं।
यूपीजीएमए और नेबर जॉइनिंग ट्री में क्या समानताएं हैं?
- फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ों का निर्माण करते समय दोनों विधियाँ क्लस्टरिंग तकनीकों का उपयोग करती हैं।
- इसके अलावा, दोनों विधियों में फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ की व्याख्या करने के लिए गणितीय एल्गोरिदम के उपयोग की आवश्यकता होती है।
- डीएनए अनुक्रम डेटा दोनों विधियों में एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं।
- दोनों विधियों का परिणाम बॉटम-अप क्लस्टरिंग विधि में होता है।
- इसके अलावा, दोनों तकनीकों का उपयोग करके बड़े डेटा सेट का विश्लेषण संभव है।
- बूटस्ट्रैप पद्धति का उपयोग करके दोनों प्रकार के पेड़ों के लिए सांख्यिकीय डेटा विश्लेषण लागू किया जा सकता है।
- दोनों जीवों के वर्गीकरण और पहचान में महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं।
- इसके अलावा, दोनों विधियां जीवों के विकासवादी संबंधों पर डेटा प्रदान करती हैं।
यूपीजीएमए और नेबर जॉइनिंग ट्री में क्या अंतर है?
यूपीजीएमए और पडोसी जॉइनिंग ट्री के बीच मुख्य अंतर निर्मित पेड़ के प्रकार पर निर्भर करता है। तो, यूपीजीएमए एक जड़ वाला पेड़ पैदा करता है जबकि पड़ोसी पेड़ से जुड़ता है एक अनियंत्रित पेड़ पैदा करता है। इसके अलावा, यूपीजीएमए एक कम विश्वसनीय तरीका है जबकि पड़ोसी पेड़ से जुड़ना यूपीजीएमए की तुलना में एक विश्वसनीय तरीका है।तो, यूपीजीएमए और पड़ोसी के पेड़ में शामिल होने के बीच यह एक और अंतर है।
नीचे दी गई जानकारी-ग्राफिक यूपीजीएमए और पड़ोसी पेड़ में शामिल होने के बीच अंतर को सारांशित करती है।
सारांश - यूपीजीएमए बनाम पड़ोसी पेड़ में शामिल होना
UPGMA और पडोसी ज्वाइनिंग ट्री मेथड्स दो तकनीकें हैं जो एक फाईलोजेनेटिक ट्री के निर्माण के दौरान महत्वपूर्ण हैं। जबकि UPGMA पद्धति विकास दर पर विचार नहीं करती है, पड़ोसी जुड़ने की विधि इसे वृक्ष निर्माण के दौरान मानती है। इस प्रकार, NJ ट्री विधि से उत्पन्न होने वाले फ़ाइलोजेनेटिक ट्री की जटिलता और विश्वसनीयता अधिक है। हालाँकि, यह UPGMA पद्धति जितनी तेज़ नहीं है। इसके अलावा, यूपीजीएमए और पड़ोसी पेड़ में शामिल होने के बीच महत्वपूर्ण अंतर प्रत्येक तकनीक के परिणामस्वरूप पेड़ के प्रकार पर निर्भर करता है।UPGMA के परिणामस्वरूप एक रूटेड फ़ाइलोजेनेटिक ट्री होता है जबकि पड़ोसी ट्री मेथड में शामिल होने के परिणामस्वरूप एक अनरूटेड फ़ाइलोजेनेटिक ट्री होता है।
