मुख्य अंतर - बैक्टीरियल ट्रांसपोज़ेस बनाम रेट्रोवायरल इंटीग्रेज
परिवहन योग्य आनुवंशिक सामग्री दो प्रमुख रणनीतियों के साथ विकसित हुई है जो एक क्षेत्र से दूसरे क्षेत्र में और जीनोम के बीच स्थानांतरित करने के लिए है। एक तरीका डीएनए अणु के निर्माण से पहले आरएनए अणु के माध्यम से विस्थापित करना है जबकि दूसरे मार्ग में डीएनए मध्यवर्ती शामिल हैं। ट्रांसपोज़ेस और वायरल इंटीग्रेज ऐसे ट्रांसपोज़ेबल जेनेटिक मटीरियल के उदाहरण हैं। बैक्टीरियल ट्रांसपोज़ेस ट्रांसपोज़न के अंत तक बंधते हैं और विभिन्न तंत्रों के माध्यम से जीनोम के दूसरे हिस्से में ट्रांसपोज़न आंदोलन के उत्प्रेरण की सुविधा प्रदान करते हैं।रेट्रोवायरल इंटीग्रेज एंजाइम होते हैं जो एचआईवी जैसे रेट्रोवायरस की आनुवंशिक सामग्री को मेजबान सेल की आनुवंशिक सामग्री (डीएनए) में एकीकृत करने में सहायता करते हैं। यह बैक्टीरियल ट्रांसपोज़ेस और रेट्रोवायरल इंटीग्रेज के बीच महत्वपूर्ण अंतर है।
जीवाणु संक्रमण क्या हैं?
ट्रांसपोज़ेज़ को ट्रांसपोज़न के अंत तक बंधे एक एंजाइम के रूप में परिभाषित किया जा सकता है जो विभिन्न तंत्रों के माध्यम से जीनोम के दूसरे हिस्से में ट्रांसपोज़न आंदोलन के उत्प्रेरण की सुविधा प्रदान करता है। इस तरह के तंत्र में 'कट एंड पेस्ट मैकेनिज्म' और 'रेप्लिकेटिव ट्रांसपोजिशन मैकेनिज्म' शामिल हैं। ट्रांसपोज़ेज़ को पहली बार एंजाइम के क्लोनिंग के माध्यम से पेश किया गया था जो कि Tn3 ट्रांसपोसॉन के स्थानान्तरण के लिए आवश्यक है। जीनोम के बीच या एक साइट से दूसरी साइट पर विस्थापन के लिए ट्रांसपोज़ेबल जेनेटिक तत्वों द्वारा दो महत्वपूर्ण रणनीतियों का उपयोग किया गया है। डीएनए कॉपी के संश्लेषण से पहले आरएनए के एक मध्यवर्ती के माध्यम से परिवहन एक रणनीति है जबकि दूसरे को अकेले डीएनए मध्यवर्ती के लिए बाध्य किया जा रहा है।दोनों तत्वों के एकीकरण में शामिल पुनर्संयोजन प्रतिक्रियाएं तत्व-विशिष्ट एंजाइमों के कारण होती हैं। इस प्रकार, डीएनए तत्वों के एक उदाहरण में, इन एंजाइमों को ट्रांसपोज़ेज़ के रूप में जाना जाता है जबकि आरएनए तत्वों के एक उदाहरण में, उन्हें इंटीग्रेज के रूप में जाना जाता है।
दोनों स्थानान्तरण रणनीतियों के बीच अंतर की तुलना करते समय, सम्मिलन की प्रक्रिया रासायनिक रूप से समान प्रतीत होती है। लेकिन, हाल के साक्ष्य का प्रस्ताव है कि एकीकरण तंत्र में कुछ समानताएं अमीनो एसिड अनुक्रमों के क्षेत्रों में देखी जाती हैं जो एक सक्रिय साइट बनाती हैं; डीडीई मूल भाव। ट्रांसपोज़ेज़ के पाँच परिवारों को वर्तमान में वर्गीकृत किया जा रहा है, लेकिन नए ट्रांसपोज़ेज़ वर्णों के साथ परिवारों की संख्या में वृद्धि होनी बाकी है। परिवारों में डीडीई ट्रांसपोज़ेज़, टायरोसिन (वाई) ट्रांसपोज़ेज़, सेरीन (एस) ट्रांसपोज़ेज़, रोलिंग सर्कल ट्रांसपोज़ेज़, रिवर्स ट्रांसक्रिपटेस / एंडोन्यूक्लाइज़ (आरटी / एन) आदि शामिल हैं। ये परिवार डीएनए को तोड़ने और फिर से जोड़ने के लिए अद्वितीय उत्प्रेरक तंत्र का उपयोग करते हैं।डीडीई ट्रांसपोज़ेज़ मूल ट्रांसपोज़न के कट और पेस्ट तंत्र में शामिल होता है और संरक्षित अमीनो एसिड के तीन सेटों को वहन करता है; एस्पार्टेट (डी), एस्पार्टेट (डी) और ग्लूटामेट (ई)। tyrosine transposases भी tyrosine अवशेषों के उपयोग द्वारा कट और पेस्ट तंत्र में शामिल होता है, जो साइट-विशिष्ट है।
चित्र 01: बैक्टीरियल ट्रांसपोज़ेस
सेरीन ट्रांसपोज़ेज़ में सर्कुलर डीएनए का एक मध्यवर्ती शामिल होता है और उपरोक्त परिवारों की तरह ही कट और पेस्ट तंत्र को अंजाम देता है। रोलिंग सर्कल ट्रांसपोज़ेज़ कॉपी-इन मैकेनिज्म में शामिल होता है जहां डीएनए प्रतिकृति के माध्यम से एक सिंगल स्ट्रैंड को सीधे लक्ष्य साइट में कॉपी किया जाता है। यह सुनिश्चित करता है कि टेम्प्लेट स्ट्रैंड और कॉपी किए गए स्ट्रैंड में एक स्ट्रैंड होता है जिसे नव संश्लेषित किया जाता है।रिवर्स ट्रांसक्रिपटेस/एंडोन्यूक्लिअस ट्रांसपोज़ेज़ में ट्रांसपोज़िशन के लिए विभिन्न तंत्र हैं।
रेट्रोवायरल इंटीग्रेज क्या हैं?
रेट्रोवायरल इंटीग्रेज के संदर्भ में, इसे एक रेट्रोवायरल एंजाइम माना जाता है जो एचआईवी जैसे रेट्रोवायरस की आनुवंशिक सामग्री को संक्रमित कोशिका के आनुवंशिक सामग्री (डीएनए) में एकीकृत करने में सहायता करता है। ये रेट्रोवायरल इंटीग्रेज अक्सर फेज इंटीग्रेज के साथ भ्रमित हो जाते हैं। फेज इंटीग्रेज के उदाहरण फेज इंटीग्रेज हैं। लेकिन ये पूरी तरह से अलग एंजाइम हैं और इनसे भ्रमित नहीं होना चाहिए। रेट्रोवायरल प्री-इंटीग्रेशन कॉम्प्लेक्स के गठन के संबंध में, रेट्रोवायरल इंटीग्रेज एक प्रमुख भूमिका निभाता है। रेट्रोवायरल इंटीग्रेज प्रोटीन में आमतौर पर तीन (03) कैनोनिकल डोमेन होते हैं। ये डोमेन लचीले लिंकर्स द्वारा जुड़े हुए हैं।
तीन डोमेन में एक एन टर्मिनल जिंक-बाइंडिंग डोमेन शामिल है जहां तीन पेचदार बंडल जुड़े हुए हैं और एक Zn2+ केशन, एक RNase H फोल्ड की भागीदारी के साथ समन्वय के माध्यम से स्थिर होते हैं। कैटेलिटिक कोर डोमेन और एक सी टर्मिनल डीएनए बाइंडिंग डोमेन, जो एक SH3 फोल्ड है।जांच और जैव रासायनिक और संरचनात्मक जानकारी के माध्यम से, यह सुझाव देता है कि रेट्रोवायरल इंटीग्रेज में डिमर (टेट्रामर) के डिमर के रूप में कार्य करने की क्षमता है। मल्टीमेराइजेशन और वायरल डीएनए बाइंडिंग के संदर्भ में, रेट्रोवायरल इंटीग्रेज प्रोटीन के तीनों डोमेन। रेट्रोवायरल इंटीग्रेज का प्रमुख कार्य डीएनए को होस्ट करने के लिए अपनी आनुवंशिक सामग्री को सम्मिलित करना है। यह कदम एचआईवी वायरस के वायरल प्रतिकृति में सबसे महत्वपूर्ण कदम है। एक बार सफलतापूर्वक एकीकृत होने के बाद, यह कोशिका के क्रोमोसोमल डीएनए में शेष जीवन काल तक रहेगा।
चित्र 02: रेट्रोवायरल इंटीग्रेज
इसलिए, एक बार एकीकृत होने के बाद सेल के लिए कोई वापसी नहीं होती है। ये रेट्रोवायरल इंटीग्रेज दो प्रमुख प्रतिक्रियाओं को उत्प्रेरित करने में शामिल हैं जिनमें 3 'अंत प्रसंस्करण और सहसंयोजक बंधन शामिल हैं।3 'अंत प्रसंस्करण के दौरान, वायरल डीएनए के 3' सिरों से 2-3 न्यूक्लियोटाइड को वायरल डीएनए के 3 'सिरों के सीए डाइन्यूक्लियोटाइड्स को प्रकट करने के इरादे से हटा दिया जाता है, और सहसंयोजक बंधन के दौरान, संसाधित 3' सिरों को हटा दिया जाता है। वायरल डीएनए सहसंयोजक रूप से मेजबान क्रोमोसोमल डीएनए में जुड़ा हुआ है।
बैक्टीरिया ट्रांसपोज़ेस और रेट्रोवायरल इंटीग्रेज के बीच समानता क्या है?
बैक्टीरियल ट्रांसपोज़ेस और रेट्रोवायरल इंटीग्रेज दोनों में समान अमीनो एसिड अनुक्रम होते हैं।
बैक्टीरियल ट्रांसपोज़ेस और रेट्रोवायरल इंटीग्रेज में क्या अंतर है?
बैक्टीरियल ट्रांसपोज़ेस बनाम रेट्रोवायरल इंटीग्रेज |
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| बैक्टीरियल ट्रांसपोज़ेज़ एक एंजाइम है जो ट्रांसपोज़न के अंत तक बंधा होता है, जबकि विभिन्न तंत्रों के माध्यम से जीनोम के दूसरे हिस्से में ट्रांसपोज़न आंदोलन के उत्प्रेरण की सुविधा प्रदान करता है। | रेट्रोवायरल इंटीग्रेज को एक रेट्रोवायरल एंजाइम माना जाता है जो एचआईवी जैसे रेट्रोवायरस की आनुवंशिक सामग्री को संक्रमित कोशिका के आनुवंशिक पदार्थ (डीएनए) में एकीकृत करने में सहायता करता है। |
| बाध्यकारी क्षेत्र | |
| जीवाणु संक्रमण के लिए उच्च विशिष्ट बाध्यकारी क्षेत्रों की आवश्यकता होती है। | बाध्यकारी के लिए कम या कोई न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम की आवश्यकता नहीं है। |
सारांश - बैक्टीरियल ट्रांसपोज़ेस बनाम रेट्रोवायरल इंटीग्रेज
बैक्टीरिया ट्रांसपोज़ेज़ को एक रेट्रोवायरल एंजाइम माना जाता है जो एचआईवी जैसे रेट्रोवायरस की आनुवंशिक सामग्री को संक्रमित कोशिका के आनुवंशिक पदार्थ (डीएनए) में एकीकृत करने में सहायता करता है। जीनोम के बीच या एक साइट से दूसरी साइट पर विस्थापन के लिए ट्रांसपोज़ेबल जेनेटिक तत्वों द्वारा दो महत्वपूर्ण रणनीतियों का उपयोग किया गया है।ट्रांसपोज़ेज़ के पाँच परिवारों को वर्तमान में वर्गीकृत किया जा रहा है, लेकिन नए ट्रांसपोज़ेज़ वर्णों के साथ परिवारों की संख्या में वृद्धि होनी बाकी है। रेट्रोवायरल इंटीग्रेज, इसे एक रेट्रोवायरल एंजाइम के रूप में माना जाता है जो एचआईवी जैसे रेट्रोवायरस की आनुवंशिक सामग्री को संक्रमित कोशिका के आनुवंशिक सामग्री (डीएनए) में एकीकृत करने में सहायता करता है। रेट्रोवायरल इंटीग्रेज प्रोटीन में आमतौर पर तीन (03) कैनोनिकल डोमेन होते हैं। रेट्रोवायरल इंटीग्रेज का प्रमुख कार्य डीएनए को होस्ट करने के लिए अपनी आनुवंशिक सामग्री को सम्मिलित करना है। यह कदम एचआईवी वायरस के वायरल प्रतिकृति में सबसे महत्वपूर्ण कदम है। इसलिए, एक बार एकीकृत होने के बाद सेल के लिए कोई वापसी नहीं होती है। बैक्टीरियल ट्रांसपोज़ेस और रेट्रोवायरल इंटीग्रेज के बीच यही अंतर है।
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